Análise epigenômica integrativa de gliomas - definindo regiões regulatórias associadas ao "stemness" e ao fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2

• Processo: 19/14928-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2024
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Beneficiário: Tathiane Maistro Malta Pereira
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/00583-0 - Análise epigenômica integrativa de gliomas: definindo regiões regulatórias associadas ao stemness e ao fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2, AP.JP
• Assunto(s): Glioma Metilação de DNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: DNA methylation | epigenomic | glioma | Idh1 | Omic | stemness | Bioinformática e Oncologia

Resumo

Os gliomas malignos adultos são tumores cerebrais heterogêneos caracterizados por recorrência e progressão com padrões variáveis. Embora alguns progressos tenham sido observados nos últimos anos, os gliomas ainda apresentam uma classificação de doença sub-ótima que pode afetar o manejo do paciente e dificultar o tratamento correto. Mutação nos genes IDH, o fenótipo hipermetilador G-CIMP e a co-deleção dos braços cromossômicos 1p/19q são fatores moleculares associados a subtipos de gliomas e que melhoram sua classificação. Notavelmente, evidências crescentes sugerem que a metilação aberrante do DNA desempenha um papel importante no desenvolvimento e/ou progressão dos gliomas. Nos glioblastomas, acredita-se que o estado de diferenciação celular afeta as propriedades das células tumorais e que a existência de células-tronco tumorais está associada a progressão tumoral e resistência terapêutica. Pretendemos realizar uma análise epigenômica abrangente e integrada para definir as regiões genômicas regulatórias associadas ao "stemness" nos gliomas e ao fenótipo hipermetilador ocasionados pela mutação nos genes IDH1/2 em gliomas e em outros tipos tumorais. Nossos achados podem fornecer: 1) elucidação dos mecanismos de tumorigênese e progressão tumoral; 2) mecanismos potenciais relacionados à metilação do DNA e à desregulação do metabolismo em tumores com mutação em IDH1/2; e 3) potencial aplicação dos resultados, como a identificação de biomarcadores que prevêem progressão e resistência a medicamentos, novos alvos para o desenvolvimento de fármacos, o refinamento da classificação tumoral molecular existente permitindo uma melhor estratificação para tratamento personalizado.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VARN, FREDERICK S.; JOHNSON, KEVIN C.; MARTINEK, JAN; HUSE, JASON T.; NASRALLAH, MACLEAN P.; WESSELING, PIETER; COOPER, LEE A. D.; MALTA, TATHIANE M.; WADE, TAYLOR E.; SABEDOT, THAIS S.; et al. Glioma progression is shaped by genetic evolution and microenvironment interactions. Cell, v. 185, n. 12, p. 33-pg., 2022-06-09. (19/14928-1)

LARISSA MIYUKI OKANO; LÍVIA MARIA MACIEL DA FONSECA; ISABELA DIAS ERTHAL; TATHIANE MAISTRO MALTA. Epigenomic integrative analysis pinpoint master regulator transcription factors associated with tumorigenesis in squamous cell carcinoma of oral tongue. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 46, n. 2, 2023-06-19. (19/14928-1, 18/00583-0, 21/08190-0)