Aplicação da bioinformática na análise do genoma e transcriptoma de bovinos Nelore, integrando informações pública

• Processo: 19/16732-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Lucia Galvão de Albuquerque
• Beneficiário: Larissa Fernanda Simielli Fonseca
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore, AP.TEM
• Assunto(s): Transcriptoma Biologia computacional Bovinos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bancos de dados genômicos | bovinos | Transcriptoma | Bioinformática

Resumo

As tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) aumentam consideravelmente as possibilidades de aplicação de informações moleculares no desenvolvimento de pesquisas científicas, possibilitando a caracterização da variabilidade no genoma de uma espécie e investigação de suas consequências a nível transcricional e fenotípico. Cerca de 100 touros da raça Nelore, escolhidos devido à contribuição no rebanho nacional, terão o genoma completo sequenciado e alinhado com a sequência de referência bovina UMD 3.1, para o desenvolvimento do projeto Temático "Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore". Este projeto temático também irá realizar o sequenciamento de RNA total extraído dos tecidos muscular e hepático, em grupos de animais Nelore de maior e menor eficiência alimentar. Sabendo-se que conhecimentos de bioinformática serão essenciais para a análise e interpretação de tais informações, o presente projeto visa, primeiramente, assessorar, na área de bioinformática, todos os estudos a serem realizados no referido projeto temático. Além disto, no presente projeto, o sequenciamento completo do genoma e transcriptoma de animais zebuínos da raça Nelore será utilizado para comparações com informações públicas de mesmo caráter, visando analisar o histórico demográfico das subespécies Boas taurus taurus (taurinos) e Bos taurus indicus (zebuínos) e identificar novos transcritos com potencial codificante, expressos em bovinos.