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Integração de dados de transcriptoma com dados clínicos e imunológicos

Processo: 19/27146-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de abril de 2020
Vigência (Término): 31 de março de 2024
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Imunologia - Imunogenética
Pesquisador responsável:Helder Takashi Imoto Nakaya
Beneficiário:Amanda Pereira Vasconcelos
Instituição-sede: Centro de Inovação da USP (INOVA). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/14933-2 - Biologia integrativa aplicada à saúde humana, AP.JP2
Assunto(s):Biologia de sistemas   Transcriptoma   Febre amarela   Sepse   Fisiopatologia

Resumo

Dados relacionados com a saúde humana estão sendo gerados e acumulados em uma quantidade sem precedentes na história. A análise e integração destas informações são fundamentais para melhorar nosso entendimento sobre a fisiopatologia das doenças, sua transmissão, assim como seu diagnóstico e tratamento. Esse projeto objetiva realizar uma análise integrativa de dados clínicos e de transcriptoma, em condições inflamatórias tais como Febre Amarela e Sepse, e investigar as complexas interações entre os componentes biológicos. Para isso, realizaremos análise de expressão diferencial, identificação dos módulos gênicos específicos para cada uma das condições inflamatórias e análises de enriquecimento de vias de sinalização dos dados de transcriptoma. Faremos também uma análise dos dados clínicos, identificando fatores de risco, preditivos, prognósticos e diagnósticos associados às doenças. Finalmente, realizaremos a integração de dados clínicos e moleculares, utilizando ferramentas de machine learning, para identificação de genes cuja expressão na fase aguda permitem predizer a mortalidade de pacientes. Espera-se que os resultados gerados com esse projeto possam esclarecer diversos mecanismos moleculares das doenças estudadas e melhorar a qualidade de vida dos pacientes. (AU)