Integrando abordagens proteogenômicas e de biologia de sistemas para investigar os papéis da melanopsina e canais TRP na ritmicidade circadiana

• Processo: 20/04524-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Fisiologia - Fisiologia de Órgãos e Sistemas
• Pesquisador responsável: Ana Maria de Lauro Castrucci
• Beneficiário: José Thalles Jocelino Gomes de Lacerda
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/24615-5 - Derrubando um paradigma? Melanopsina, um fotopigmento canônico, atuando como sensor para ajuste do relógio em órgãos não expostos à luz, e sua possível interação com canais TRP: estudo transdisciplinar envolvendo aspectos fisiológicos e patológicos, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/16606-4 - Tecnologias avançadas de espectrometria de massa direcionada para a descoberta de isoformas de proteínas que são impulsionadoras da doença arterial coronariana (DAC), BE.EP.PD
• Assunto(s): Proteogenômica Ritmo circadiano Biologia computacional Melanopsinas Tecido adiposo marrom Tecido adiposo branco Estresse fisiológico Processamento de proteína pós-traducional Interação proteína-proteína
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia de redes e sistemas | Estresse Metabólico | Modificações pós-traducionais | Proteogenômica | ritmo circadiano | tecidos periféricos | Proteômica e bioinformática

Resumo

Com base no objetivo do referido projeto temático, a proposta de pesquisa tem como principal abordagem a análise proteômica por LC-ESI-MS/MS, para realizar uma avaliação comparativa (qualitativa e quantitativa) de coração, tecidos adiposos marrom e branco dos modelos animais WT e KO e, assim, obter uma maior compreensão sobre os papeis dos genes Opn4, TrpV1, TrpM8, TrpA1 e AdrB1 e suas associações, na fisiologia do ritmo circadiano sob condições de estresse metabólico (Obesidade e Caquexia) e desafio de baixa temperatura. Embora a análise transcriptômica, já realizada pelo grupo de pesquisa, possa fornecer informações valiosas sobre esse cenário, alguns estudos têm relatado diferenças entre dados de transcriptoma e proteoma devido a regulações pós-transcricionais e modificações pós-transducionais (Post-Translational Modifications, PTMs). Análises proteômicas tem demonstrado que algumas PTMs podem regular fatores de transcrição e, consequentemente, modular o transcriptoma. Além disso, as PTMs (ex: fosforilação, ubiquitinação, glicosilação, biotinilação, acetilação) fazem parte do mecanismo pelo qual o relógio circadiano controla o metabolismo. A partir destas informações, os objetivos da proposta são: (1) realizar análise proteômica comparativa dos tecidos de animais WT e KO para os genes citados e também das linhagens celulares. A análise será qualitativa e quantitativa (Label-free quantification ou TMT-MS); (2) usar os dados do transcriptoma como banco de dados para análise proteômica - abordagem proteogenômica; (3) comparar os dados quantitativos da análise transcriptômica e proteômica; (4) a partir dos dados obtidos pelas "ômicas", realizar análise de enriquecimento funcional e criar redes de interação proteína-proteína para compreender as alterações das vias metabólicas e dos processos biológicos; (5) realizar uma análise comparativa de PTMs. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MONTEIRO DE ASSIS, LEONARDO VINICIUS; LACERDA, JOSE THALLES; MORAES, MARIA NATHALIA; DOMINGUEZ-AMOROCHO, OMAR ALBERTO; KINKER, GABRIELA SARTI; MENDES, DAVI; SILVA, MATHEUS MOLINA; MARTINS MENCK, CARLOS FREDERICO; SARAIVA CAMARA, NIELS OLSEN; DE LAURO CASTRUCCI, ANA MARIA. Melanopsin (Opn4) is an oncogene in cutaneous melanoma. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 5, n. 1, p. 15-pg., 2022-05-13. (19/19435-3, 19/25129-2, 17/24217-0, 17/26651-9, 18/16511-8, 12/50214-4, 18/14728-0, 17/24615-5, 17/18781-0, 20/04524-8, 13/24337-4, 17/16711-4)

LACERDA, JOSE THALLES; GOMES, PATRICIA R. L.; ZANETTI, GIOVANNA; MEZZALIRA, NATHANA; LIMA, OTONIEL G.; DE ASSIS, LEONARDO V. M.; GULER, ALI; CASTRUCCI, ANA MARIA; MORAES, MARIA NATHALIA. Lack of TRPV1 Channel Modulates Mouse Gene Expression and Liver Proteome with Glucose Metabolism Changes. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 23, n. 13, p. 24-pg., 2022-07-01. (17/24615-5, 21/01659-2, 14/16412-9, 20/04524-8, 18/23915-8, 18/16511-8, 13/02131-5, 12/50214-4, 18/14728-0, 17/26651-9, 21/09923-0)

LACERDA, JOSE THALLES; DAVID, DANIELA DANTAS; CASTRUCCI, ANA MARIA L.. The effect of thermal stress on the X-organ/sinus gland proteome of the estuarine blue crab Callinectes sapidus during the intermolt and premolt stages. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 313, p. 15-pg., 2025-03-20. (17/24615-5, 20/04524-8, 18/23043-0)

SUA-CESPEDES, CRISTHIAN; LACERDA, JOSE THALLES; ZANETTI, GIOVANNA; DAVID, DANIELA DANTAS; MORAES, MARIA NATHALIA; DE ASSIS, LEONARDO V. M.; CASTRUCCI, ANA MARIA L.. Melanopsin (OPN4) is a novel player in skin homeostasis and attenuates UVA-induced effects. JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY B-BIOLOGY, v. 242, p. 15-pg., 2023-04-03. (16/00696-3, 13/07937-8, 19/19005-9, 21/01659-2, 17/26651-9, 18/23043-0, 18/16511-8, 12/50214-4, 12/12663-1, 18/14728-0, 17/24615-5, 20/04524-8, 14/16412-9)