Avaliação molecular da prevalência e aplicação de métodos de sequenciamento de última geração para identificação de vírus emergentes na área de hemoterapia

• Processo: 20/13194-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Vigência (Início): 01 de novembro de 2020
• Vigência (Término): 31 de outubro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Svetoslav Nanev Slavov
• Beneficiário: Victória Simionatto Zucherato
• Instituição Sede: Hemocentro de Ribeirão Preto. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da USP (HCMRP). Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/23205-8 - Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas, AP.JP
• Assunto(s): Doadores de sangue Vírus Técnicas de genotipagem Sequenciamento de nova geração Reação em cadeia por polimerase (PCR)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Doadores de sangue | Genotipagem | Hemoterapia | Pcr | Sequenciamento de última geração | Virus Emergentes | Doenças infecciosas transmissíveis via transfusão de sangue

Resumo

A presente proposta visa a aplicação de métodos moleculares para detecção de vírus emergentes em amostras de doadores de sangue como parte de um estudo de vigilância genômica dos vírus emergentes identificados via sequenciamento de última geração no projeto Jovem Pesquisador 17/23205-8. Durante a análise bioinformática foram identificados vários vírus emergentes com possível impacto na medicina transfusional como os gemykibivírus humanos 1 e 2 e o vírus da influenza A, bem como vírus com transmissão transfusional comprovada como dengue vírus to tipo 2 e parvovírus humano B19. Ainda nesta proposta o bolsista de treinamento técnico aprenderá técnicas básicas de sequenciamento de última geração como preparação de transcriptoma e bibliotecas genômicas. A detecção direta desses agentes em doadores de sangue bem como em amostras com informação pós-doação trará um panorama melhor sobre a sua disseminação na população geral bem como características genômicas e impacto na transfusão de sangue. (AU)

Publicações científicas

(7)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

VALENCA, IAN NUNES; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE OLIVEIRA, LUCIANA CORREA OLIVEIRA; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Deep viral metagenomics in patients with haemophilia receiving plasma-derived coagulation factor concentrates. HAEMOPHILIA, v. 27, n. 5, JUL 2021. (20/13194-1, 17/23205-8, 19/08528-0, 19/07861-8)

BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; XIMENEZ, JOAO PAULO BIANCHI; GIOVANETTI, MARTA; ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; BITENCOURT, HELEN TAYANA; ZIMMERMANN, ANA; ALCANTARA JUNIOR, LUIZ CARLOS JUNIOR; COVAS, DIMAS TADEU; KASHIMA, SIMONE; SLAVOV, SVETOSLAV NANEV. Metavirome composition of Brazilian blood donors positive for the routinely tested blood-borne infections. VIRUS RESEARCH, v. 311, p. 7-pg., 2022-04-02. (20/13194-1, 17/23205-8, 19/08528-0, 18/15826-5)

ZANETTE, DALILA LUCIOLA; COELHO, KAROLINE BRITO CAETANO ANDRADE; DE CARVALHO, ENEAS; AOKI, MATEUS NOBREGA; NARDIN, JEANINE MARIE; LALLI, LARISSA ARAUJO; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; GIOVANETTI, MARTA; ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; DE CAMPOS, GABRIEL MONTENEGRO; et al. Metagenomic insights into the plasma virome of Brazilian patients with prostate cancer. MOLECULAR & CELLULAR ONCOLOGY, v. 10, n. 1, p. 9-pg., 2023-12-31. (19/08528-0, 22/00910-6, 17/23205-8, 20/13194-1)

ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; EVARISTO, MARIANE; SANTOS, ELAINE VIEIRA; MELLO, RALYRIA; CANDIDO, ERIKA DONIZETTI; ARAUJO, DANIELLE BASTOS; GIOVANETTI, MARTA; ALCANTARA, LUIZ CARLOS JUNIOR; CILIAO-ALVES, DAIANI CRISTINA; HADDAD, RODRIGO; et al. SARS-CoV-2 serological cross-reactivity testing in Brazilian blood donors, October-December, 2019. Journal of Infection, v. 84, n. 2, p. 2-pg., 2022-02-01. (20/13194-1, 17/23205-8)

ZUCHERATO, VICTORIA SIMIONATTO; DA COSTA, PERICLES NATAN MENDES; GIOVANETTI, MARTA; KRAUSE, LUCIANA MARIA FONTANARI; ALVES, DAIANI CRISTINA CILIAO; MOREIRA, RENATA MARIA ALENCAR; PIMENTEL, BARBARA MACIEL SIDOU; HADDAD, RODRIGO; BITENCOURT, HELLEN TAYANA; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Merkel cell polyomavirus (MCPyV) DNA prevalence in Brazilian blood donors. TRANSFUSION CLINIQUE ET BIOLOGIQUE, v. 30, n. 1, p. 4-pg., 2023-01-31. (20/13194-1, 17/23205-8, 18/15826-5)

CAVALCANTE SOUZA, JULIANA VANESSA; SANTOS, HAZERRAL DE OLIVEIRA; LEITE, ANDERSON BRANDAO; GIOVANETTI, MARTA; BEZERRA, RAFAEL DOS SANTOS; DE CARVALHO, ENEAS; TODAO BERNARDINO, JARDELINA DE SOUZA; VIALA, VINCENT LOUIS; HADDAD, RODRIGO; CICCOZZI, MASSIMO; et al. Viral Metagenomics for the Identification of Emerging Infections in Clinical Samples with Inconclusive Dengue, Zika, and Chikungunya Viral Amplification. Viruses-Basel, v. 14, n. 9, p. 8-pg., 2022-09-01. (17/23205-8, 18/15826-5, 21/09446-8, 21/11944-6, 20/13194-1, 19/08528-0)

I.N. VALENÇA; F.A. RÓS; V.S. ZUCHERATO; A.C. SILVA-PINTO; D.T. COVAS; S. KASHIMA; S.N. SLAVOV. Comparative metavirome analysis in polytransfused patients. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 54, n. 12, 2021-10-18. (19/07861-8, 17/23205-8, 20/13194-1, 18/15826-5, 19/22155-2)