Evidenciando regiões centroméricas em Trypanosoma cruzi: uma abordagem in silico e experimental

• Processo: 22/12897-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2023
• Data de Término da vigência: 06 de julho de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
• Beneficiário: Kellana dos Santos e Silva
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/15553-9 - Indo a fundo na regulação da cromatina de Trypanosoma cruzi: identificação de novas moléculas e questionando seu possível impacto no controle da transcrição, AP.JP2
• Assunto(s): Centrômero Trypanosoma cruzi
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Centromero | ChIP-seq | Cinetócoro | Hi-C | Kkt | Trypanosoma cruzi | genética e proteômica

Resumo

O Trypanosoma cruzi possui peculiaridades na organização genômica e na expressão gênica tais como transcrição policistrônica, trans-splicing e regulação daexpressão gênica majoritariamente pós transcricional. A mitose em T. cruzi ocorre com semi-condensação dos cromossomos,impossibilitando o uso da citogenéticaclássica para determinar o número exato de cromossomos. Dentre as características genômicas de T. cruzi,as regiões centroméricas são pouco conhecidas, apesar da importância na segregação cromossômica e seu impacto na arquitetura do genoma. Os padrões de organização do genoma, incluindo os associados às regiões centroméricas, são detectados utilizando técnicas de Chromosome Conformation Capture (3C), tais como o Hi-C. Compreender como os cromossomos se organizam e compactam pode fornecer informações sobre as complexas relações da organização nuclear e a posição dos centrômeros. Localizados nas regiões centroméricas estão os cinetocoros, que são um complexo macromolecular quegoverna a segregação cromossômica. Nenhuma das proteínas canônicas do cinetocoro foi identificada em tripanossomatídeos, porém as proteínas KKT (kinetoplastid kinetochore protein) encontradas unicamente nos tripanossomatídeos,foram descritas como presentes nos cinetocoros. Neste trabalho, exploraremos asputativas regiões centroméricas determinadas pela técnica de Hi-C através de análises in silico e experimentais com a geração de linhagens taggeadas para duas proteínas KKTs, seguido da localização genômica por Chip-seq