Extensão Projeto Genoma Câncer

Resumo

Uma tarefa fundamental na análise de genomas é a identificação de genes. Isto é relativamente muito mais factível no caso de genomas compactos, mas muito mais desafiador para os genomas complexos, como no caso do genoma humano. O uso de estratégias computacionais para a identificação de genes em genomas complexos ainda não é uma rotina e está ficando cada vez mais claro que a identificação de genes dependerá principalmente do alinhamento de sequencias genômicas completas com sequencias de cDNA "full-Iength". A importância das informações contidas em cDNAs tem sido reconhecida desde o começo do Projeto genoma Humano. Entretanto, o sequenciamento de cDNAs completos em larga escala ainda requer avanços técnicos como a produção de bibliotecas de cDNAs enriquecidas de transcritos de grande tamanho e raros. Sequenciamento parcial de expressed sequence tags (ESTs) representa uma estratégia para a geração de larga escala de cDNAs. Elas representam uma estratégia poderosa para a catalogação de genes, mas devido à tendência de conterem sequencias prioritariamente das extremidades 5' e 3' da molécula de cDNA, elas são inapropriadas para a caracterização de genes completos. ORESTES é uma estratégia alternativa para gerar ESTs da porção central dos transcritos que podem ser sistemática e eficientemente geradas em larga escala. Os dados de ORESTES complementam sequencias das ESTs convencionais que cobrem as porções 3' e 5' e permitem, em potencial, o sequenciamento shotgun do transcriptoma humano. (AU)