Estudo dos mecanismos de ativação e desativação de receptores hormonais nucleares por simulações de dinâmica molecular

Resumo

Pretende-se aplicar técnicas de simulação por Dinâmica Molecular (DM) ao estudo de Receptores Hormonais Nucleares e suas interações com os respectivos ligantes naturais (hormônios) e análogos sintéticos, visando elucidar mecanismos de ativação e inibição de receptores em escala atômico/molecular. O foco incidirá inicialmente sobre o Receptor do Hormônio Tireoideano (TR), dando continuidade aos trabalhos já em andamento. Serão empregadas técnicas de DM de processamento paralelo no estudo sistemático dos mecanismos de ação dos hormônios naturais, agonistas e antagonistas sintéticos sobre os receptores TR nativos bem como mutantes, especialmente aqueles associados à Síndrome de Resistência ao Hormônio Tireoideano. O desenvolvimento do projeto requer alta capacidade de processamento, pois é indispensável a inclusão explicita do solvente (~13 mil moléculas de água). Para tal, pretende-se empregar computação paralela utilizando um cluster composto por 8 micro-computadores Athlon Duais, adquiridos no país, com uma excelente razão custo/beneficio. (AU)