Caracterização de RNAs-não codificantes no extremófilo Halobacterium salinarum

Resumo

Mudanças no padrão de expressão gênica são responsáveis por muitas das diferenças fenotípicas encontradas entre as espécies. Uma importante classe de moléculas regulatórias que tem chamado a atenção dos pesquisadores nos últimos anos e tem sido descrita como parte integrante do processo de expressão gênica em diversos organismos, são os RNAs não-codificantes. Apesar de já terem sido identificados em archaea, a participação dos ncRNAs nos processos regulatórios no terceiro domínio da vida ainda não está bem estabelecido. Este trabalho pretende promover a caracterização de alguns RNAs não-codificantes de Halobacterium salinarum, uma archaea halófila obrigatória. Para isto, será efetuada uma seleção inicial de aproximadamente dez ncRNAs modulados durante o crescimento de H. salinarum, que por sua vez, terão suas extremidades 5' e 3' precisamente determinadas. Esses ncRNAs serão superexpressos e terão sua funcionalidade avaliada de forma global pela expressão diferencial nos níveis de mRNAs das linhagens selvagem e linhagens superexpressando os ncRNAs de interesse. Além disto, a predição estrutural e a predição dos alvos dos RNAs não-codificantes selecionados serão realizadas, utilizando ferramentas de bioinformática. Os dados gerados serão analisados e incluídos no modelo global de regulação gênica da célula.