Associação genômica ampla (GWAS) aplicada a características reprodutivas de novilhas da raça Nelore

Resumo

Características reprodutivas são de extrema importância dentro do sistema de produção pecuária, por influenciar a quantidade de animais que serão destinados ao mercado e o intervalo de gerações da população, além do ganho genético/ano. No entanto, identificar esses animais mais precoces é, geralmente, um processo complicado, dado a complexidade que envolve essas características. Os avanços alcançados na área da genômica nos últimos anos possibilitam, hoje, estudos de identificação e caracterização de genes ou marcadores de genes que influenciam características poligênicas nos animais domésticos. A identificação de marcadores do tipo SNP, que apresentem associação importante com características reprodutivas traria importante contribuição para a seleção das mesmas. O objetivo do trabalho será desenvolver estudos de associação genômica ampla (GWAS) visando estudar efeitos de substituição alélica e também identificar regiões no genoma associadas com a precocidade sexual e a produtividade de vacas na raça Nelore. O experimento será conduzido junto ao Grupo de Melhoramento Genético Animal e Biotecnologia (GMAB) da Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos da Universidade de São Paulo (FZEA/USP). O banco de dados será formado por 1.500 fêmeas da raça Nelore de, no mínimo, três diferentes populações. As análises de GWAS serão realizadas com auxilio das ferramentas bioestatísticas PLINK e GenABEL, sendo que os efeitos de substituição alélica serão preditos por diferentes métodos estatísticos (RRBLUP, GBLUP, Bayes A, B, R), visando verificar o método de melhor ajuste.