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Caracterização molecular de isolados de Escherichia coli provenientes do meio ambiente

Processo: 18/19539-0
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Regular
Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2019
Data de Término da vigência: 31 de julho de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Eliana Guedes Stehling
Beneficiário:Eliana Guedes Stehling
Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Assunto(s):Solos  Microbiologia ambiental  Tipagem de sequências multilocus  Água  Virulência  Resistência  Escherichia coli 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:água | Escherichia coli | Mlst | Resistência | solo | Virulência | Microbiologia Ambiental

Resumo

A resistência bacteriana é um problema frequente no ambiente hospitalar. O aumento da resistência entre os membros da família Enterobacteriaceae tem resultado no aparecimento de espécies multirresistentes, as quais representam um importante problema de saúde pública. Dentre as enterobactérias mais comumente relatadas em infecções hospitalares está a Escherichia coli, a qual pertence a microbiota comensal e pode atuar como patógeno oportunista, principalmente em pacientes imunocomprometidos. Diferentes classes de antimicrobianos podem ser utilizados no tratamento de infecções causadas por esse patógeno, e dentre eles, as classes dos ²-lactâmicos, quinolonas e fluoroquinolonas, tetraciclinas, aminoglicosídeos, inibidores da via de folato e polimixinas. Diversos fatores de virulência estão correlacionados à patogenicidade dessa bactéria, entre eles, as toxinas e hemolisinas. O objetivo do presente projeto de pesquisa é caracterizar 50 isolados de Escherichia coli obtidos do meio ambiente quanto à resistência aos antimicrobianos, virulência, relação clonal e epidemiológica. O sequenciamento do genoma completo dos isolados que apresentarem maior potencial de resistência e virulência e/ou dos isolados que apresentarem um potencial fenotípico de resistência e não apresentarem os genes pesquisados permitirá detectar novos genes associados a esse fenótipo ou genes pouco relatados. (AU)

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Publicações científicas (26)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; STEHLING, ELIANA GUEDES. enomic characterization of multidrug-resistant extraintestinal pathogenic Escherichia coli isolated from grain culture soil. Pedosphere, v. 32, n. 3, p. 495-502, . (18/19539-0, 18/01890-3)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LOPES, RALF; RAMOS, MICAELA SANTANA; RODRIGUES DOS SANTOS, LUCAS DAVID; ROSA, RAFAEL DA SILVA; SAVAZZI, EDUARDO ANGELINO; STEHLING, ELIANA GUEDES. Colistin-resistant mcr-1-positive Escherichia coli ST1775-H137 co-harboring bla(CTX-M-2) and bla(CMY-2) recovered from an urban stream. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 96, . (18/01890-3, 18/19539-0)
FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; LOPES, RALF; STEHLING, ELIANA GUEDES. Multidrug resistance IncC plasmid carrying bla(CMY-97) in Shiga toxin-producing Escherichia coli ST215-H54 of ovine origin. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 93, . (18/19539-0, 18/01890-3)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LOPES, RALF; LIMA GONZALEZ, IRYS HANY; RAMOS, PATRICIA LOCOSQUE; VON ZESKA KRESS, MARCIA REGINA; STEHLING, ELIANA GUEDES. Hypermucoviscous/hypervirulent and extensively drug-resistant QnrB2-, QnrS1-, and CTX-M-3-coproducing Klebsiella pneumoniae ST2121 isolated from an infected elephant (Loxodonta africana). Veterinary Microbiology, v. 251, . (18/19539-0)
DE MELO, FERNANDA MACIEL; RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; SANCHEZ, DANILO GARCIA; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; SAVAZZI, EDUARDO ANGELINO; STEHLING, ELIANA GUEDES. Dispersion of merA and catabolic genes in Brazilian water sources. ECOLOGICAL INDICATORS, v. 108, . (18/01890-3, 18/19539-0)
FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; DA SILVA FERREIRA, MARCIA ELIANA; STEHLING, ELIANA GUEDES. Genetic Diversity of Multidrug-Resistant CMY-Producing Escherichia coli from Feces and Soil in a Small-Scale Pig Farm. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 26, n. 11, . (18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; SAVAZZI, EDUARDO ANGELINO; STEHLING, ELIANA GUEDES. Genomic insights into multidrug-resistant and hypervirulent Klebsiella pneumoniae co-harboring metal resistance genes in aquatic environments. ECOTOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL SAFETY, v. 201, . (18/19539-0)
RAMOS, MICAELA SANTANA; RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; RODRIGUES DOS SANTOS, LUCAS DAVID; DE CAMPOS, TATIANA AMABILE; SAVAZZI, EDUARDO ANGELINO; STEHLING, ELIANA GUEDES. High Level of Resistance to Antimicrobials and Heavy Metals in Multidrug-Resistant Pseudomonas sp. Isolated from Water Sources. Current Microbiology, v. 77, n. 10, . (18/01890-3, 18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; RODRIGUES DOS SANTOS, LUCAS DAVID; SILVA MORETTO, JESSICA APARECIDA; RAMOS, MICAELA SANTANA; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; DIAS ALVES, GEORGIA DE ASSIS; PAULELLI, ANA CAROLINA; DE SOUZA ROCHA, CECILIA CRISTINA; CESILA, CIBELE APARECIDA; GALLIMBERTI, MATHEUS; et al. Occurrence and abundance of clinically relevant antimicrobial resistance genes in environmental samples after the Brumadinho dam disaster, Brazil. Science of The Total Environment, v. 726, . (18/24069-3, 18/01890-3, 18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; MOURA, QUEZIA; LIMA GONZALEZ, IRYS HANY; RAMOS, PATRICIA LOCOSQUE; LINCOPAN, NILTON; STEHLING, ELIANA GUEDES. Draft genome sequence of a multidrug-resistant CTX-M-65-producing Escherichia coli ST156 colonizing a giant anteater (Myrmecophaga tridactyla) in a Zoo. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 17, p. 2-pg., . (16/08593-9, 18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; PIRES DE CAMPOS, ANNA CAROLINA LEONELLI; PASSAGLIA, JAQUELINE; FALCAO, JULIANA PFRIMER; NAVARRO, ARMANDO; NAKAZATO, GERSON; STEHLING, ELIANA GUEDES. Molecular characterization of multidrug-resistant Shiga toxin-producing Escherichia coli harboring antimicrobial resistance genes obtained from a farmhouse. PATHOGENS AND GLOBAL HEALTH, . (18/19539-0)
DOS SANTOS, L. D. R.; FURLAN, J. P. R.; GALLO, I. F. L.; RAMOS, M. S.; SAVAZZI, E. A.; STEHLING, E. G.. Occurrence of multidrug-resistant Enterococcus faecium isolated from environmental samples. Letters in Applied Microbiology, v. 73, n. 2, p. 237-246, . (18/01890-3, 18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; GONCALVES DE ALMEIDA, OTAVIO GUILHERME; PEREIRA DE MARTINIS, ELAINE CRISTINA; STEHLING, ELIANA GUEDES. Characterization of an Environmental Multidrug-Resistant Acinetobacter seifertii and Comparative Genomic Analysis Reveals Co-occurrence of Antimicrobial Resistance and Metal Tolerance Determinants. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 10, . (18/01890-3, 18/19539-0, 17/13759-6)
RODRIGUES DOS SANTOS, LUCAS DAVID; RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; RAMOS, MICAELA SANTANA; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; PEREIRA DE FREITAS, LUCAS VICTOR; STEHLING, ELIANA GUEDES. Co-occurrence of mcr-1, mcr-3, mcr-7 and clinically relevant antimicrobial resistance genes in environmental and fecal samples. Archives of Microbiology, v. 202, n. 7, . (18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; DE CAMPOS, TATIANA AMABILE; STEHLING, ELIANA GUEDES. Genomic Characterization of a Multidrug-Resistant and Hypermucoviscous/Hypervirulent Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae ST4417 Isolated from a Sewage Treatment Plant. MICROBIAL DRUG RESISTANCE, v. 26, n. 11, . (18/01890-3, 18/19539-0)
SILVA MORETTO, JESSICA APARECIDA; RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; BRAZ, VANIA SANTOS; BITENCOURT, TAMIRES APARECIDA; STEHLING, ELIANA GUEDES. Presence of bla(OXA-48)-carrying IncF plasmid in an Escherichia fergusonii strain isolated from a sugarcane soil. Pedosphere, v. 30, n. 2, p. 293-294, . (18/01890-3, 18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; STEHLING, ELIANA GUEDES. Molecular characterization of an extensively drug-resistant Acinetobacter baumannii isolated from a corn culture soil. Pedosphere, v. 31, n. 6, p. 973-976, . (18/01890-3, 18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; LEONELLI PIRES DE CAMPOS, ANNA CAROLINA; NAVARRO, ARMANDO; TAKAYAMA KOBAYASHI, RENATA KATSUKO; NAKAZATO, GERSON; STEHLING, ELIANA GUEDES. Characterization of non-O157 Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) obtained from feces of sheep in Brazil. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, v. 35, n. 9, . (18/19539-0)
FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; DOS SANTOS, LUCAS DAVID RODRIGUES; RAMOS, MICAELA SANTANA; GALLO, INARA FERNANDA LAGE; STEHLING, ELIANA GUEDES. Fecal cultivable aerobic microbiota of dairy cows and calves acting as reservoir of clinically relevant antimicrobial resistance genes. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 3, . (18/19539-0)
BARDAJI, DANAE KALA RODRIGUEZ; MORETTO, JESSICA APARECIDA SILVA; FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; STEHLING, ELIANA GUEDES. A mini-review: current advances in polyethylene biodegradation. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, v. 36, n. 2, . (18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; LAGE GALLO, INARA FERNANDA; PIRES DE CAMPOS, ANNA CAROLINA LEONELLI; PASSAGLIA, JAQUELINE; FALCAO, JULIANA PFRIMER; NAVARRO, ARMANDO; NAKAZATO, GERSON; STEHLING, ELIANA GUEDES. Molecular characterization of multidrug-resistant Shiga toxin-producing Escherichia coli harboring antimicrobial resistance genes obtained from a farmhouse. PATHOGENS AND GLOBAL HEALTH, v. 113, n. 6, p. 7-pg., . (18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; RODRIGUES DOS SANTOS, LUCAS DAVID. Presence of Colistin Resistancemcr-4Gene and Clinically Relevant Antimicrobial Resistance Genes in Sand Samples from a Public Beach. WATER AIR AND SOIL POLLUTION, v. 231, n. 7, . (18/01890-3, 18/19539-0)
LOPES, RALF; FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; DOS SANTOS, LUCAS DAVID RODRIGUES; GALLO, INARA FERNANDA LAGE; STEHLING, ELIANA GUEDES. Colistin-Resistant mcr-1-Positive Escherichia coli ST131-H22 Carrying bla(CTX-M-15) and qnrB19 in Agricultural Soil. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 12, . (18/01890-3, 18/19539-0)
FURLAN, JOAO PEDRO RUEDA; GONZALEZ, IRYS HANY LIMA; RAMOS, PATRICIA LOCOSQUE; STEHLING, ELIANA GUEDES. International high-risk clone of multidrug-resistant CTX-M-8-producing Escherichia coli C-ST410 infecting an elephant (Loxodonta africana) in a zoo. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 22, p. 3-pg., . (18/19539-0)
RUEDA FURLAN, JOAO PEDRO; STEHLING, ELIANA GUEDES. Draft genome sequence of a multidrug-resistant Escherichia coli ST189 carrying several acquired antimicrobial resistance genes obtained from Brazilian soil. JOURNAL OF GLOBAL ANTIMICROBIAL RESISTANCE, v. 17, p. 2-pg., . (18/19539-0)