Proteômica estrutural: desenho, síntese e aplicação de agentes de ligação cruzada de nova geração

Resumo

A determinação da estrutura de proteínas e suas interações com outras proteínas são informações chaves na elucidação do mecanismo de ação dessas macromoléculas. A ligação cruzada associada à Espectrometria de Massas (EM) é uma técnica que permite a caracterização estrutural de proteínas e complexos proteicos, especialmente nos casos em que as técnicas de alta resolução não podem ser empregadas. Por ser baseada em EM, essa técnica é universal, podendo ser aplicada a uma grande variedade de proteínas. Além disso, a técnica se beneficia de todas as vantagens da EM, como alta sensibilidade, rapidez de análise e facilidade de uso. Embora a estrutura de vários complexos proteína-proteína já tenham sido resolvidas com sucesso, há ainda limitações a serem superadas para que a estratégia de ligação-cruzada/EM seja ainda mais abrangente. Entre os maiores desafios destacam-se a dificuldade em detectar e identificar as espécies modificadas pelos agentes de ligações cruzadas (ALCs), resultando em um número limitado de informações estruturais a respeito do sistema de interesse. O presente projeto visa o desenvolvimento de novos ALCs visando resolver os problemas mencionados acima, permitindo o enriquecimento das espécies modificadas e superando a dificuldade de detecção. Objetiva-se que esses ALCs facilitem a identificação dessas espécies através do uso de marcadores de defeito de massa, que permitem uma distinção mais clara entre espécies modificadas e não modificadas. As novas famílias de ALCs propostas aqui tem o potencial de gerar um grande avanço na qualidade dos dados obtidos e aumentar significativamente a aplicabilidade desta técnica. (AU)