Investigação de um potencial regulador de transcrição em Trypanosoma cruzi por avaliação de transcritos nascentes do genoma global

Resumo

Em tripanossomas, é bem aceito que a expressão genica é regulada principalmente por mecanismos pós traducionais devido à ausência de regiões promotoras clássicas para RNA Pol II e transcrição do tipo policistronica. Entretanto, ensaios de Run-on indicaram que genes satélites tem menor nível de expressão, e uma diminuição significativa na transcrição global é observada quando formas replicativas são comparadas com não-replicativas (ex: metaciclicas) sugerindo algum nível de regulação da transcrição (Elias, Marques-Porto et al. 2001, Ferreira, Dossin Fde et al. 2008). Adicionalmente, foi observado em Leishmania (gênero da ordem Trypanosomatida) que genes associados à ciclo celular podem ser regulados a nível transcricional (Chandra, Yadav et al. 2017). Então, aqui queremos investigar, numa escala do genoma global, a taxa de transcrição de todas as regiões genômicas de T.cruzi. Assim, iremos realizar sequenciamento global Run-on (GRO-seq) seguido por uma analise computacional intensa incluindo integração com bases de dado públicas. Análises de transcritos nascentes também serão exploradas para interrogar uma potencial regulação da transcrição durante a diferenciação EàM e durante o ciclo celular usando algumas regiões genômicas selecionadas detectadas em análises do genoma global. Este projeto requer esforços para ambos wet-lab e dry-lab para atingir seu completo potencial; portanto, estudantes de pós-doutorado com background prévio em ambos os treinamentos serão priorizados. (AU)