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Abordagens genéticas e epigenéticas como modelos preditivos em transtornos mentais

Processo:23/05560-6
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
Data de Início da vigência: 01 de março de 2024
Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2029
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Psiquiatria
Pesquisador responsável:Marcos Leite Santoro
Beneficiário:Marcos Leite Santoro
Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Município da Instituição Sede:São Paulo
Pesquisadores associados:Ana Claudia Trocoli Torrecilhas ; Ary Gadelha de Alencar Araripe Neto ; Bruno Takao Real Karia ; Carolina Cappi ; Eurípedes Constantino Miguel Filho ; Giovanni Abrahão Salum Júnior ; Marimélia Aparecida Porcionatto ; Pedro Mario Pan Neto ; Rodrigo Affonseca Bressan ; Síntia Iole Nogueira Belangero ; Vanessa Kiyomi Ota Kuniyoshi
Bolsa(s) vinculada(s):26/17521-3 - Análise de Ancestralidade Local da População Brasileira e remontagem de haplótipos nativo americanos e africanos para estudos populacionais., BP.DD
26/17511-8 - Abordagens Multimodais na Predição de Transtornos Mentais via Neuroimagem Epigenética em uma Coorte Brasileira com seguimento de 14 anos., BP.DD
25/20856-4 - Alterações longitudinais de miRNAs provenientes de vesículas extracelulares da infância à vida adulta: 14 anos de seguimento, BP.DD
+ mais bolsas vinculadas 25/03140-5 - Avaliação de fatores genéticos e epigenéticos no neurodesenvolvimento, BP.IC
25/02190-9 - Análise de Escores Poligênicos de Traços de Personalidade na População Brasileira, BP.IC
24/11062-1 - Alterações longitudinais de miRNAs provenientes de vesículas extracelulares da infância à vida adulta: 14 anos de seguimento, BP.MS
24/06730-5 - Harmonização dos dados de sequenciamento do genoma completo para análise de interação gene-ambiente, BP.DD
24/02453-7 - Cálculo do risco para transtornos mentais considerando variantes de nucleotídeo único (SNVs), Copy Number Variation (CNVs) e expressão de miRNAs, BP.DD
24/04224-5 - Aplicação de Escore Poligênico de Transtornos Alimentares em população miscigenada, BP.IC - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):Genética  Ancestralidade  Transtornos mentais  Esquizofrenia  Modelos preditivos  MicroRNAs  Vesículas extracelulares 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:ancestralidade | Escore poligênico | esquizofrenia | miRNA | vesículas extracelulares | Genética

Resumo

Os Transtornos Mentais (TMs) são doenças multifatoriais e apresentam herdabilidade entre 20% e 80%. Isso sugere que o genoma contém uma grande quantidade de informação com potencial de ser utilizado como marcador genético de risco para os TMs. Entretanto, a natureza poligênica dessas doenças, somada à influência de fatores ambientais, dificulta a investigação dessa informação. A expansão dos estudos genômicos em larga escala permitiu a criação de uma ferramenta preditiva chamada de escore poligênico de risco (PRS). Uma das limitações do PRS é que ele tem melhor predição na população de ancestralidade europeia, dificultando a aplicação em amostras miscigenadas. Como os TMs são doenças multifatoriais, abordagens longitudinais são essenciais para entender como o risco genético, o qual é estático, interage com variáveis dinâmicas e modificáveis. Assim, investigar alterações epigenéticas pode auxiliar a compreensão de como esses fatores se convergem. No campo da neurociência, uma das alternativas para ter acesso ao tecido cerebral é por meio da avaliação de vesículas extracelulares que podem carregar ácidos nucleicos e são capazes de atravessar a barreira hematoencefálica. Os objetivos desta proposta são divididos em dois módulos: 1) Módulo Genômico: pretendemos aprimorar as abordagens de PRS já disponíveis para a população brasileira miscigenada, aplicar a análise de ancestralidade local para remontar haplótipos nativos brasileiros, e utilizar o PRS conjuntamente com informações de variações no número de cópias (CNVs) como preditores de TMs em coortes brasileiras; 2) Módulo Epigenômico: avaliar a expressão de miRNA de vesículas extracelulares séricas de indivíduos antes e após o aparecimento de TMs. Este projeto fará uso de duas coortes brasileiras: a BHRC, que compreende 2500 famílias e possui seguimento de 10 anos, e o PUMAS-Brasil que pretende sequenciar 20 mil brasileiros em 5 cidades. Para a análise do PRS utilizaremos ambas coortes, BHRC e PUMAS-Brasil com um N combinado de ~25.000 dados de genótipo. Para o Módulo Epigenômico, utilizaremos 500 amostras provenientes da BHRC, dando prioridade para indivíduos com dados longitudinais e que converteram ou remitiram dos sintomas de TMs no período de 10 anos. O isolamento das vesículas extracelulares bem como sequenciamento do miRNA será feito de acordo com os protocolos já padronizados pelo grupo. Como principal achado científico, pretendemos 1) demonstrar a viabilidade e uma solução eficaz para a utilização do PRS em população miscigenada e 2) identificar miRNAs associados com o aparecimento de transtornos mentais e 3) integrar os dados dos dois módulos levando em consideração fatores genéticos e epigenéticos que predispõem a transição de TMs. (AU)

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Publicações científicas (4)
(As publicações científicas contidas nesta página são originárias da Web of Science ou da SciELO, cujos autores mencionaram números dos processos FAPESP concedidos a Pesquisadores Responsáveis e Beneficiários, sejam ou não autores das publicações. Sua coleta é automática e realizada diretamente naquelas bases bibliométricas)
XAVIER, GABRIELA; MAUER, JESSICA; OTA, VANESSA K.; SANTORO, MARCOS L.; BELANGERO, SINTIA I.. Influence of antipsychotic drugs on microRNA expression in schizophrenia patients - A systematic review. JOURNAL OF PSYCHIATRIC RESEARCH, v. 176, p. 10-pg., . (20/02247-7, 16/19462-2, 23/05560-6)
XAVIER, GABRIELA; OTA, VANESSA; KAJITANI, GUSTAVO SATORU; MAUER, JESSICA H.; ASPRINO, PAULA FONTES; COSTA, GIOVANY OLIVEIRA; CAVALCANTE, DANIEL A.; CERQUEIRA, RAPHAEL; NOVAES, ANTONIO; SANTOS, FELIPE R. DOS; et al. Dysregulation of miR-335-5p, miR-30d-5p, and miR-744-5p in extracellular vesicles from first-episode psychosis patients: Implications for biomarker discovery. SCHIZOPHRENIA RESEARCH, v. 286, p. 8-pg., . (16/19462-2, 10/08968-6, 17/18246-7, 14/07280-1, 23/05560-6, 17/25016-8)
BRUXEL, ESTELA M.; ROVARIS, DIEGO L.; BELANGERO, SINTIA I.; CHAVARRIA-SOLEY, GABRIELA; CUELLAR-BARBOZA, ALFREDO B.; MARTINEZ-MAGANA, JOSE J.; NAGAMATSU, SHEILA T.; NIEVERGELT, CAROLINE M.; NUNEZ-RIOS, DIANA L.; OTA, VANESSA K.; et al. Psychiatric genetics in the diverse landscape of Latin American populations. Nature Genetics, v. N/A, p. 15-pg., . (19/13229-2, 21/15030-9, 20/15752-1, 20/05652-0, 23/05560-6, 23/12252-6)
ARENDT, JULIA; ZAMARIOLLI, MALU; ALMODOBAR, LIRIEL; ITO, LUCAS TOSHIO; ORMOND, RAFAELLA; OLIVEIRA, ADRIELLE M.; OTA, VANESSA KIYOMI; ROHDE, LUIS AUGUSTO; MIGUEL, EURIPEDES CONSTANTINO; PAN, PEDRO MARIO; et al. Copy number variations in the Brazilian High-Risk Cohort for Mental Conditions. Revista Brasileira de Psiquiatria, v. 47, p. 11-pg., . (21/05332-8, 21/12901-9, 08/57896-8, 23/05560-6, 24/02453-7, 23/00437-1, 21/04591-0)