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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Biological network border detection

Texto completo
Autor(es):
Burke, Paulo E. P. [1] ; Comin, Cesar H. [2] ; Silva, Filipi N. [3] ; Costa, Luciano da F. [3]
Número total de Autores: 4
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Bioinformat Grad Program, Sao Carlos, SP - Brazil
[2] Univ Fed Sao Carlos, Dept Comp Sci, Sao Carlos, SP - Brazil
[3] Univ Sao Paulo, Sao Carlos Inst Phys, POB 369, BR-13560970 Sao Carlos, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 3
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: INTEGRATIVE BIOLOGY; v. 9, n. 12, p. 947-955, DEC 2017.
Citações Web of Science: 1
Resumo

Complex networks have been widely used to model biological systems. The concept of accessibility has been proposed recently as a means to organize the nodes of complex networks as belonging to its border or center. Such an approach paves the way to investigating how the functional and structural properties of nodes vary with their respective position in the networks. In this work, we approach such a problem in a biological context applying border detection to Protein-Protein Interaction networks from four organisms of the Mycoplasma genus. We found evidence that the borderness of proteins bears a relation with their spatial organization and molecular function specificity. (AU)

Processo FAPESP: 15/18942-8 - Associando redes complexas com espaços efetivos de atributos
Beneficiário:Cesar Henrique Comin
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 15/08003-4 - Abordagem de redes complexas em e-Science e dados dinâmicos
Beneficiário:Filipi Nascimento Silva
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 11/50761-2 - Modelos e métodos de e-Science para ciências da vida e agrárias
Beneficiário:Roberto Marcondes Cesar Junior
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático