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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Iron Deficiency Generates Oxidative Stress and Activation of the SOS Response in Caulobacter crescentus

Texto completo
Autor(es):
Leaden, Laura [1] ; Silva, Larissa G. [1] ; Ribeiro, Rodolfo A. [1] ; dos Santos, Naara M. [1] ; Lorenzetti, Alan P. R. [2] ; Alegria, Thiago G. P. [3] ; Schulz, Mariane L. [4] ; Medeiros, Marisa H. G. [4] ; Koide, Tie [2] ; Marques, V, Marilis
Número total de Autores: 10
Afiliação do(s) autor(es):
[1] V, Univ Sao Paulo, Inst Ciencias Biomed, Dept Microbiol, Sao Paulo - Brazil
[2] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Dept Bioquim & Imunol, Ribeirao Preto - Brazil
[3] Univ Sao Paulo, Inst Biociencias, Dept Genet & Biol Evolut, Sao Paulo - Brazil
[4] Univ Sao Paulo, Inst Quim, Dept Bioquim, Sao Paulo - Brazil
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: FRONTIERS IN MICROBIOLOGY; v. 9, AUG 28 2018.
Citações Web of Science: 5
Resumo

In C. crescentus, iron metabolism is mainly controlled by the transcription factor Fur (ferric uptake regulator). Iron-bound Fur represses genes related to iron uptake and can directly activate the expression of genes for iron-containing proteins. In this work, we used total RNA sequencing (RNA-seq) of wild type C. crescentus growing in minimal medium under iron limitation and a fur mutant strain to expand the known Fur regulon, and to identify novel iron-regulated genes. The RNA-seq of cultures treated with the iron chelator 2-2-dypiridyl (DP) allowed identifying 256 upregulated genes and 236 downregulated genes, being 176 and 204 newly identified, respectively. Sixteen transcription factors and seven sRNAs were upregulated in iron limitation, suggesting that the response to low iron triggers a complex regulatory network. Notably, lexA along with most of its target genes were upregulated, suggesting that DP treatment caused DNA damage, and the SOS DNA repair response was activated in a RecA-dependent manner, as confirmed by RT-qPCR. Fluorescence microscopy assays using an oxidation-sensitive dye showed that wild type cells in iron limitation and the fur mutant were under endogenous oxidative stress, and a direct measurement of cellular H2O2 showed that cells in iron-limited media present a higher amount of endogenous H2O2. A mutagenesis assay using the rpoB gene as a reporter showed that iron limitation led to an increase in the mutagenesis rate. These results showed that iron deficiency causes C. crescentus cells to suffer oxidative stress and to activate the SOS response, indicating an increase in DNA damage. (AU)

Processo FAPESP: 15/21038-1 - O transcritoma antisense da Archaea halofílica Halobacterium salinarum
Beneficiário:Tie Koide
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo FAPESP: 15/07386-7 - Identificação de RNAs regulatórios em resposta à disponibilidade de ferro e seus mecanismos de ação em Caulobacter crescentus
Beneficiário:Laura Leaden
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Processo FAPESP: 16/06378-3 - Caracterização da dead box-RNA helicase CC1478 em Caulobacter crescentus e sua regulação
Beneficiário:Rodolfo Alvarenga Ribeiro
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 14/04046-8 - Sistemas regulatórios da resposta bacteriana a estresses
Beneficiário:Marilis Do Valle Marques
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 17/03052-2 - RNAs não codificantes derivados de sequências de inserção na arqueia halófila Halobacterium salinarum NRC-1
Beneficiário:Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 17/02127-9 - Caracterização de sistemas de transporte de ferro em Caulobacter crescentus
Beneficiário:Naara Marcondes dos Santos
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Mestrado