Genomic resources for energy cane breeding in the post genomics era

Autor(es)

Diniz, Augusto L. ^[1] ; Ferreira, Savio S. ^[2] ; Ten-Caten, Felipe ^[1] ; Margarido, Gabriel R. A. ^[3] ; dos Santos, Joao M. ^[4] ; Barbosa, Geraldo V. de S. ^[4] ; Carneiro, Monalisa S. ^[5] ; Souza, Glaucia M. ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Inst Quim, Dept Bioquim, Av Prof Lineu Prestes 748, BR-05508000 Sao Paulo, SP - Brazil

^[2] Univ Sao Paulo, Inst Biociencias, Dept Bot, Rua Matao 277, BR-05508090 Sao Paulo, SP - Brazil

^[3] Univ Sao Paulo, Dept Genet, Escola Super Agr Luiz de Queiroz, Ave Padua Dias 11, BR-13418900 Piracicaba, SP - Brazil

^[4] Univ Fed Alagoas, Ctr Ciencias Agr, Dept Fitotecnia & Fitossanidade, BR 104 Norte, Km 85, BR-57100000 Rio Largo, AL - Brazil

^[5] Univ Fed Sao Carlos, Ctr Ciencias Agr, Dept Biotecnol & Prod Vegetal & Anim, Rodovia Anhanguera Km 174, BR-13600970 Araras, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo de Revisão
• Fonte: COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL; v. 17, p. 1404-1414, 2019.
• Citações Web of Science: 0

Resumo

Sugarcane is one of the most sustainable energy crops among cultivated crops presenting the highest tonnage of cultivated plants. Its high productivity of sugar, bioethanol and bioelectricity make it a promising green alternative to petroleum. Furthermore, the myriad of products that can be derived from sugarcane biomass has been driving breeding programs towards varieties with a higher yield of fiber and a more vigorous and sustainable performance: the energy cane. Here we provide an overview of the energy cane including plant description, breeding efforts, types, and end-uses. In addition, we describe recently published genomic resources for the development of this crop, discuss current knowledge of cell wall metabolism, bioinformatic tools and databases available for the community. (C) 2019 The Authors. Published by Elsevier B.V. on behalf of Research Network of Computational and Structural Biotechnology. (AU)

• Processo FAPESP: 14/50921-8 - Redes regulatórias e sinalização associadas à cana energia
• Beneficiário: Glaucia Mendes Souza
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Temático
• Processo FAPESP: 16/06917-1 - Análise do transcriptoma e construção de redes de co-expressão em sistemas modelo para identificação de genes envolvidos na deposição de parede celular secundária e no metabolismo de lignina em gramíneas
• Beneficiário: Sávio de Siqueira Ferreira
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 15/22993-7 - Transcriptômica para identificação de genes de interesse comercial em cana-de-açúcar
• Beneficiário: Gabriel Rodrigues Alves Margarido
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa BIOEN - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 17/02842-0 - Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para a plataforma SUCEST-FUN
• Beneficiário: Felipe ten Caten
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Processo FAPESP: 17/02270-6 - Avaliação do transcriptoma de progênies contrastantes para o acúmulo de biomassa e identificação de redes de regulação
• Beneficiário: Augusto Lima Diniz
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado