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Avaliação do transcriptoma de progênies contrastantes para o acúmulo de biomassa e identificação de redes de regulação

Processo: 17/02270-6
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2017
Situação:Interrompido
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Glaucia Mendes Souza
Beneficiário:Augusto Lima Diniz
Instituição-sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/50921-8 - Redes regulatórias e sinalização associadas à cana energia, AP.BIOEN.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):19/15852-9 - Perfil transcricional e redes de co-expressão em cana-de-açúcar, BE.EP.PD
Assunto(s):Genômica funcional   Transcriptoma   Biologia de sistemas   Biomassa   Cana-de-açúcar   Cana-energia   Carbono   Regulação metabólica   Parede celular vegetal

Resumo

O desenvolvimento da tecnologia do bioetanol celulósico, no qual o bagaço é utilizado para produção de bioetanol, tem gerado interesse no desenvolvimento da cana-energia, que possui mais fibra e biomassa. O desenvolvimento da cana-energia favorecerá a produção de etanol celulósico e sua biomassa também poderá ser utilizada em termoquímicas e biorrefinarias com a produção integrada de múltiplos produtos incluindo biocombustíveis, bioeletricidade, compostos químicos, biogás e calor. A cada variedade de cana-de-açúcar lançada tem se observado menores ganhos de produtividade, o que pode ser causado pela base genética estreita das variedades comerciais (Dal-Bianco, Carneiro et al. 2012). As análises de cruzamentos com genótipos ancestrais de cana vêm suprir a necessidade de aumento da base genética usada no desenvolvimento dos híbridos comerciais modernos. Neste projeto analisaremos a fisiologia e bioquímica de progênies de cruzamentos entre variedades comerciais e ancestrais e selecionaremos genótipos com características desejáveis à cana-energia para o estudo do transcriptoma. Para desenvolvimento da cana-energia faz-se necessário modificar as características da cana-de-açúcar, alterando a partição de carbono de açúcar para biomassa. Tal estratégia envolve o conhecimento das redes de regulação do metabolismo de parede celular secundária, principal componente da biomassa vegetal. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Concluído o maior sequenciamento do genoma da cana-de-açúcar comercial 

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; NISHIYAMA, MILTON YUTAKA; TEN-CATEN, FELIPE; RAGAGNIN, GEOVANI TOLFO; ANDRADE, PABLO DE MORAIS; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO; NICASTRO, GIANLUCCA GONCALVES; PANDYA, RAVI; KIM, CHANGSOO; GUO, HUI; DURHAM, ALAN MITCHELL; CARNEIRO, MONALISA SAMPAIO; ZHANG, JISEN; ZHANG, XINGTAN; ZHANG, QING; MING, RAY; SCHATZ, MICHAEL C.; DAVIDSON, BOB; PATERSON, ANDREW H.; HECKERMAN, DAVID. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12 DEC 2019. Citações Web of Science: 2.
DINIZ, AUGUSTO L.; FERREIRA, SAVIO S.; TEN-CATEN, FELIPE; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; DOS SANTOS, JOAO M.; BARBOSA, GERALDO V. DE S.; CARNEIRO, MONALISA S.; SOUZA, GLAUCIA M. Genomic resources for energy cane breeding in the post genomics era. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, v. 17, p. 1404-1414, 2019. Citações Web of Science: 0.

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