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Avaliação do transcriptoma de progênies contrastantes para o acúmulo de biomassa e identificação de redes de regulação

Processo: 17/02270-6
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2017
Vigência (Término): 31 de janeiro de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:Glaucia Mendes Souza
Beneficiário:Augusto Lima Diniz
Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/50921-8 - Redes regulatórias e sinalização associadas à cana energia, AP.BIOEN.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):19/15852-9 - Perfil transcricional e redes de co-expressão em cana-de-açúcar, BE.EP.PD
Assunto(s):Genômica funcional   Transcriptoma   Biologia de sistemas   Biomassa   Cana-de-açúcar   Cana-energia   Carbono   Regulação metabólica   Parede celular vegetal
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biologia de sistemas | cana-de-açúcar | Cana-energia | Genômica | Transcriptômica | Genômica funcional

Resumo

O desenvolvimento da tecnologia do bioetanol celulósico, no qual o bagaço é utilizado para produção de bioetanol, tem gerado interesse no desenvolvimento da cana-energia, que possui mais fibra e biomassa. O desenvolvimento da cana-energia favorecerá a produção de etanol celulósico e sua biomassa também poderá ser utilizada em termoquímicas e biorrefinarias com a produção integrada de múltiplos produtos incluindo biocombustíveis, bioeletricidade, compostos químicos, biogás e calor. A cada variedade de cana-de-açúcar lançada tem se observado menores ganhos de produtividade, o que pode ser causado pela base genética estreita das variedades comerciais (Dal-Bianco, Carneiro et al. 2012). As análises de cruzamentos com genótipos ancestrais de cana vêm suprir a necessidade de aumento da base genética usada no desenvolvimento dos híbridos comerciais modernos. Neste projeto analisaremos a fisiologia e bioquímica de progênies de cruzamentos entre variedades comerciais e ancestrais e selecionaremos genótipos com características desejáveis à cana-energia para o estudo do transcriptoma. Para desenvolvimento da cana-energia faz-se necessário modificar as características da cana-de-açúcar, alterando a partição de carbono de açúcar para biomassa. Tal estratégia envolve o conhecimento das redes de regulação do metabolismo de parede celular secundária, principal componente da biomassa vegetal. (AU)

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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
DINIZ, AUGUSTO L.; FERREIRA, SAVIO S.; TEN-CATEN, FELIPE; MARGARIDO, GABRIEL R. A.; DOS SANTOS, JOAO M.; BARBOSA, GERALDO V. DE S.; CARNEIRO, MONALISA S.; SOUZA, GLAUCIA M.. Genomic resources for energy cane breeding in the post genomics era. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL, v. 17, p. 1404-1414, . (14/50921-8, 16/06917-1, 15/22993-7, 17/02842-0, 17/02270-6)
FEDERICO, MARIA L.; DINIZ, AUGUSTO L.; SOUZA, GLAUCIA M.; SNOWDON, ROD; ERAZZU, LUIS. Translational genomics from sorghum (Sorghum bicolor) to sugarcane (Saccharum spp.) for bioenergy breeding. PLANT BREEDING, v. 141, n. 3, p. 10-pg., . (14/50921-8, 17/02270-6)
SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; et al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12, . (13/07467-1, 13/18322-4, 17/02842-0, 08/52074-0, 14/50921-8, 15/22993-7, 12/51062-3, 17/02270-6, 11/50761-2, 16/17545-8, 16/06917-1, 13/23048-9, 08/52146-0, 15/15346-5)
SANTINI, LUCIANE; YOSHIDA, LEONARDO; DE OLIVEIRA, KAIQUE DIAS; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; DINIZ, AUGUSTO LIMA; CANTELLI, GERALDO CESAR; NISHIYAMA-JUNIOR, MILTON YUTAKA; SOUZA, GLAUCIA MENDES. Antisense Transcription in Plants: A Systematic Review and an Update on cis-NATs of Sugarcane. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 23, n. 19, p. 21-pg., . (08/52146-0, 20/07851-0, 20/10876-4, 14/50921-8, 18/09867-0, 17/02270-6)
DINIZ, AUGUSTO LIMA; RODRIGUES DA SILVA, DANIELLE IZILDA; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LAMAS COSTA, MAXIMILLER DAL-BIANCO; TEN-CATEN, FELIPE; LI, FORREST; VILELA, ROMEL DUARTE; MENOSSI, MARCELO; WARE, DOREEN; ENDRES, LAURICIO; et al. Amino Acid and Carbohydrate Metabolism Are Coordinated to Maintain Energetic Balance during Drought in Sugarcane. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 21, n. 23, . (13/13659-0, 15/01764-0, 17/02270-6, 17/02842-0, 14/50921-8, 19/15852-9)
SOUZA, GLAUCIA MENDES; VAN SLUYS, MARIE-ANNE; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; LEE, HAYAN; MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES ALVES; HOTTA, CARLOS TAKESHI; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; DINIZ, AUGUSTO LIMA; OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS; FERREIRA, SAVIO DE SIQUEIRA; et al. Assembly of the 373k gene space of the polyploid sugarcane genome reveals reservoirs of functional diversity in the world's leading biomass crop. GIGASCIENCE, v. 8, n. 12, p. 18-pg., . (14/50921-8, 17/02842-0, 08/52074-0, 15/22993-7, 08/52146-0, 13/18322-4, 12/51062-3, 13/07467-1, 17/02270-6, 11/50761-2, 13/23048-9, 16/06917-1, 15/15346-5, 16/17545-8)

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