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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Whole-exome sequencing reveals the impact of UVA light mutagenesis in xeroderma pigmentosum variant human cells

Texto completo
Autor(es):
Moreno, Natalia Cestari [1] ; de Souza, Tiago Antonio [1] ; Machado Garcia, Camila Carriao [2, 3] ; Ruiz, Nathalia Quintero [1] ; Corradi, Camila [1] ; Castro, Ligia Pereira [1] ; Munford, Veridiana [1] ; Ienne, Susan [1] ; Alexandrov, Ludmil B. [4, 5, 6] ; Martins Menck, Carlos Frederico [1]
Número total de Autores: 10
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Inst Biomed Sci, Dept Microbiol, Sao Paulo, SP - Brazil
[2] Univ Fed Ouro Preto, NUPEB, Ouro Preto, MG - Brazil
[3] Univ Fed Ouro Preto, Biol Sci Dept, Ouro Preto, MG - Brazil
[4] Univ Calif San Diego, Dept Bioengn, La Jolla, CA 92093 - USA
[5] Univ Calif San Diego, Dept Cellular & Mol Med, La Jolla, CA 92093 - USA
[6] Univ Calif San Diego, Moores Canc Ctr, La Jolla, CA 92093 - USA
Número total de Afiliações: 6
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Nucleic Acids Research; v. 48, n. 4, p. 1941-1953, FEB 28 2020.
Citações Web of Science: 0
Resumo

UVA-induced mutagenesis was investigated in human pol eta-deficient (XP-V) cells through whole-exome sequencing. In UVA-irradiated cells, the increase in the mutation frequency in deficient cells included a remarkable contribution of C>T transitions, mainly at potential pyrimidine dimer sites. A strong contribution of C>A transversions, potentially due to oxidized bases, was also observed in non-irradiated XP-V cells, indicating that basal mutagenesis caused by oxidative stress may be related to internal tumours in XP-V patients. The low levels of mutations involving T induced by UVA indicate that pol eta is not responsible for correctly replicating T-containing pyrimidine dimers, a phenomenon known as the `A-rule'. Moreover, the mutation signature profile of UVA-irradiated XP-V cells is highly similar to the human skin cancer profile, revealing how studies involving cells deficient in DNA damage processing may be useful to understand the mechanisms of environmentally induced carcinogenesis. (AU)

Processo FAPESP: 14/15982-6 - Consequências de deficiências de reparo de lesões no genoma
Beneficiário:Carlos Frederico Martins Menck
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo FAPESP: 12/16929-6 - Efeito da luz UVA em células de pacientes com Xeroderma pigmentosum variante
Beneficiário:Natália Cestari Moreno
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo FAPESP: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco
Beneficiário:Mayana Zatz
Linha de fomento: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
Processo FAPESP: 18/06619-6 - Bioinformática aplicada ao estudo de mutagênese humana, através de dados de exomas humanos
Beneficiário:Tiago Antonio de Souza
Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico