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(Referência obtida automaticamente do Web of Science, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores.)

Viral metagenomics performed in patients with acute febrile syndrome during Toxoplasma gondii outbreak in south Brazil

Texto completo
Autor(es):
Bezerra, Rafael dos Santos [1, 2] ; Diefenbach, Cristiane Fracao [3] ; Pereira, Dalnei Veiga [3] ; Kashima, Simone [2] ; Slavov, Svetoslav Nanev [2, 4]
Número total de Autores: 5
Afiliação do(s) autor(es):
[1] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Ciencias Biol & Saude, Ribeirao Preto, SP - Brazil
[2] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Hemoctr, Ribeirao Preto, SP - Brazil
[3] Hosp Caridade Dr Astrogildo De Azevedo, Dept Hematol & Oncol, Santa Maria, RS - Brazil
[4] Univ Sao Paulo, Fac Med Ribeirao Preto, Dept Med Interna, Ribeirao Preto, SP - Brazil
Número total de Afiliações: 4
Tipo de documento: Artigo Científico
Fonte: Brazilian Journal of Infectious Diseases; v. 24, n. 3, p. 250-255, MAY-JUN 2020.
Citações Web of Science: 0
Resumo

ABSTRACT Toxoplasmosis is a zoonotic infection caused by the protozoan parasite Toxoplasma gondii. The infection is widely disseminated in the human population and is usually benign or asymptomatic. Systemic T. gondii infection presents risks for pregnant women and AIDS patients. Although rare, T. gondii can cause outbreaks in urban centers. The origin of these outbreaks is not completely understood but probably results from introduction of zoonotic T. gondii strains in the population. During such outbreaks other pathogens which mimic T. gondii acute febrile syndrome may also circulate; therefore, detailed investigation of the outbreak is of extreme importance. In this study we performed viral metagenomics next-generation sequencing (mNGS) in patient samples obtained during T. gondii outbreak in Santa Maria city, South Brazil. Specific bioinformatics pipelines specialized in virus discovery were applied in order to identify co-circulating vial agents. Epstein Barr virus and Parvovirus B19 contigs were assembled and these viruses can cause symptoms similar to toxoplasmosis. In conclusion, our findings show the importance of Metagenomics next generation sequencing (mNGS) use to help characterize the outbreak more completely and in the management of the affected patients. (AU)

Processo FAPESP: 19/07861-8 - Desenvolvimento de um pipeline de bioinformática para identificação de doenças infecciosas emergentes em pacientes em regime de transfusão crônica
Beneficiário:Ian Nunes Valença
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 18/15826-5 - Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas
Beneficiário:Svetoslav Nanev Slavov
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
Processo FAPESP: 19/08528-0 - Aplicação de métodos de bioinformática para identificação de infecções virais com impacto em hemoterapia
Beneficiário:Rafael dos Santos Bezerra
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
Processo FAPESP: 17/23205-8 - Avaliação do impacto de vírus emergentes e re-emergentes em hemoterapia e transplante de células-tronco por meio de técnicas moleculares avançadas
Beneficiário:Svetoslav Nanev Slavov
Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores