Diving into the proteomic atlas of SARS-CoV-2 infected cells

Autor(es):Mostrar menos -

Carregari, Victor C. ; Reis-de-Oliveira, Guilherme ; Crunfli, Fernanda ; Smith, Bradley J. ; de Souza, Gabriela Fabiano ; Muraro, Stefanie Primon ; Saia-Cereda, Veronica M. ; Vendramini, Pedro H. ; Baldasso, Paulo A. ; Silva-Costa, Licia C. ; Zuccoli, Giuliana S. ; Brandao-Teles, Caroline ; Antunes, Andre ; Valenca, Aline F. ; Davanzo, Gustavo G. ; Virgillio-da-Silva, Joao Victor ; Araujo, Thiago dos Reis ; Guimaraes, Raphael Campos ; Chaim, Felipe David Mendonca ; Chaim, Elinton Adami ; Onodera, Carolina Mie Kawagosi ; Ludwig, Raissa Guimaraes ; Saccon, Tatiana Dandolini ; Damasio, Andre R. L. ; Leiria, Luiz Osorio S. ; Vinolo, Marco Aurelio R. ; Farias, Alessandro S. ; Moraes-Vieira, Pedro M. ; Mori, Marcelo A. ; Modena, Jose Luiz P. ; Martins-de-Souza, Daniel

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: SCIENTIFIC REPORTS; v. 14, n. 1, p. 14-pg., 2024-03-28.

Resumo

The COVID-19 pandemic was initiated by the rapid spread of a SARS-CoV-2 strain. Though mainly classified as a respiratory disease, SARS-CoV-2 infects multiple tissues throughout the human body, leading to a wide range of symptoms in patients. To better understand how SARS-CoV-2 affects the proteome from cells with different ontologies, this work generated an infectome atlas of 9 cell models, including cells from brain, blood, digestive system, and adipocyte tissue. Our data shows that SARS-CoV-2 infection mainly trigger dysregulations on proteins related to cellular structure and energy metabolism. Despite these pivotal processes, heterogeneity of infection was also observed, highlighting many proteins and pathways uniquely dysregulated in one cell type or ontological group. These data have been made searchable online via a tool that will permit future submissions of proteomic data (https://reisdeoliveira.shinyapps.io/Infectome_App/) to enrich and expand this knowledgebase. (AU)

• Processo FAPESP: 13/07607-8 - CMPO - Centro Multidisciplinar de Pesquisa em Obesidade e Doenças Associadas
• Beneficiário: Licio Augusto Velloso
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 13/07559-3 - Instituto Brasileiro de Neurociência e Neurotecnologia - BRAINN
• Beneficiário: Fernando Cendes
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 20/05601-6 - Neutrophil extracelular traps (NETs): importância na patogênese e potencial alvo terapêutico na COVID-19
• Beneficiário: Fernando de Queiroz Cunha
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 14/10068-4 - EMU concedido no processo 13/08711-3: espectrômetro de massas Waters SYNAPT G2-Si HDMs + nanoACQUITY UPLC
• Beneficiário: Daniel Martins-de-Souza
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 17/25588-1 - Da compreensão básica a biomarcadores clínicos para a esquizofrenia: um estudo multidisciplinar centrado na neuroproteômica
• Beneficiário: Daniel Martins-de-Souza
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 13/08216-2 - CPDI - Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias
• Beneficiário: Fernando de Queiroz Cunha
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão - CEPIDs
• Processo FAPESP: 19/11457-8 - Avaliação multifatorial de transtornos de ansiedade e depressão em pacientes com epilepsia e acompanhantes
• Beneficiário: Rafael Batista João
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 19/00098-7 - EMU concedido no processo 2017/25588-1: cromatógrafo Acquity UPLC I-Class
• Beneficiário: Daniel Martins-de-Souza
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
• Processo FAPESP: 20/04919-2 - Determinando candidatos moleculares que contribuem para o risco elevado de COVID-19 em indivíduos idosos
• Beneficiário: Marcelo Alves da Silva Mori
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 20/04860-8 - Rastreio do genoma global com bibliotecas de CRISPRko para identificação de fatores essenciais na infecção e replicação SARS-COV2
• Beneficiário: Thiago Mattar Cunha
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Processo FAPESP: 20/04746-0 - Compreensão das bases moleculares e do papel dos fatores de risco na infecção por SARS-CoV-2 em modelos pré-clínicos
• Beneficiário: Daniel Martins-de-Souza
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular