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EMU concedido no processo 13/08711-3: espectrômetro de massas Waters SYNAPT G2-Si HDMs + nanoACQUITY UPLC

Processo: 14/10068-4
Modalidade de apoio:Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Vigência: 01 de setembro de 2014 - 31 de agosto de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Daniel Martins-de-Souza
Beneficiário:Daniel Martins-de-Souza
Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08711-3 - Desenvolvimento de um teste preditivo para medicação bem sucedida e compreensão das bases moleculares da esquizofrenia através da proteômica, AP.JP
Assunto(s):Biomarcadores  Esquizofrenia  Proteômica 
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:biomarcadores | Cérebro postmortem | esquizofrenia | Oligodendrócitos | plasma sangüíneo | proteômica | Proteômica e Proteoma
As informações de acesso ao Equipamento Multiusuário são de responsabilidade do Pesquisador responsável
Página web do EMU: Página do Equipamento Multiusuário não informada
Tipo de equipamento:Caracterização de Materiais - Análises Químicas - Cromatografia líquida acoplada a espectrômetro de massa
Fabricante: Fabricante não informado
Modelo: Modelo não informado

Resumo

O espectrômetro de massas é o coração de um laboratório de proteômica. Análises proteômicas dependem totalmente de um espectrômetro de massas.O equipamento aqui proposto é parte essencial e indispensável para a execução do projeto jovem pesquisador 13/08711-3. Todas as análises propostas por este projeto bem como quaisquer colaborações com outros grupos, dependem deste equipamento, não somente para a identificação e quantificação de proteínas, mas também para seu sequenciamento (top-down proteomics) e análise de modificações pós-traducionais, além da possibilidade de ampliação de suas funções para outros campos do conhecimento, como a metabolômica, que está nos planos para um futuro a médio prazo. A escolha deste sistema foi baseada no fato de que este espetrômetro de massas em particular é capaz de executar uma tarefa que é necessária para a análise de amostras clínicas (data independent analysis) como às que serão utilizadas por este projeto. Os resultados obtidos podem ser analisados separadamente pois a quantificação é feita sem a necessidade de marcação isotópica (label-free), otimizando o poder estatístico dos resultados e consequentemente sua qualidade. Isso aumenta a chance de se revelar dados significativos para futura aplicação na prática clínica. Ainda, a possibilidade de mapeamento de modificações pós-traducionais por mobilidade iônica poderá enriquecer os estudos a serem executados, bem como as análises de "top-down proteomics" utilizando a fragmentação por ETD (Electron-transfer dissociation) por este projeto bem como aumenta sua gama de funções, favorecendo colaborações com outros grupos, que é o intuito principal de um equipamento multiusuário. (AU)

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Publicações científicas (44)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
NOWILL, ALEXANDRE E.; FORNAZIN, MARCIA C.; SPAGO, MARIA C.; DORGAN NETO, VICENTE; PINHEIRO, VITORIA R. P.; ALEXANDRE, SIMONIA S. S.; MORAES, EDGAR O.; SOUZA, GUSTAVO H. M. F.; EBERLIN, MARCOS N.; MARQUES, LYGIA A.; et al. Immune Response Resetting in Ongoing Sepsis. JOURNAL OF IMMUNOLOGY, v. 203, n. 5, p. 1298-1312, . (14/10068-4)
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WIESSNER, ISABEL; OLIVIERI, RODOLFO; FALCHI, MARCELO; PALHANO-FONTES, FERNANDA; MAIA, LUCAS OLIVIERI; FEILDING, AMANDA B.; ARAUJO, DRAULIO; RIBEIRO, SIDARTA; TOFOLI, LUIS FERNANDO. LSD, afterglow and hangover: Increased episodic memory and verbal fluency, decreased cognitive flexibility. European Neuropsychopharmacology, v. 58, p. 13-pg., . (14/10068-4, 13/07699-0)
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SILVA-COSTA, LICIA C.; SMITH, BRADLEY J.; CARREGARI, VICTOR CORASOLLA; SOUZA, GUSTAVO H. M. F.; VIEIRA, ERICA M.; MENDES-SILVA, ANA PAULA; ALMEIDA, VALERIA DE; CARVALHO, BENILTON S.; DINIZ, BRENO S.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Plasma proteomic signature of major depressive episode in the elderly. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 269, p. 9-pg., . (14/10068-4, 19/05155-9, 17/18242-1, 20/09165-6, 16/07948-8, 19/05747-3, 17/25588-1, 19/00098-7, 18/03422-7)
JOSEPH SMITH, BRADLEY; BRANDAO-TELES, CAROLINE; ZUCCOLI, GIULIANA S.; REIS-DE-OLIVEIRA, GUILHERME; FIORAMONTE, MARIANA; SAIA-CEREDA, VERONICA M.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Protein Succinylation and Malonylation as Potential Biomarkers in Schizophrenia. JOURNAL OF PERSONALIZED MEDICINE, v. 12, n. 9, p. 15-pg., . (14/10068-4, 16/07948-8, 17/25055-3, 15/23049-0, 18/01410-1, 18/14666-4, 19/05747-3, 16/07332-7, 13/08711-3, 19/00098-7, 17/25588-1)
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GARCEZ, PATRICIA P.; NASCIMENTO, JULIANA MINARDI; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA; DA COSTA, RODRIGO MADEIRO; DELVECCHIO, RODRIGO; TRINDADE, PABLO; LOIOLA, ERICK CORREIA; HIGA, LUIZA M.; CASSOLI, JULIANA S.; VITORIA, GABRIELA; et al. Zika virus disrupts molecular fingerprinting of human neurospheres. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (14/21035-0, 14/10068-4, 13/08711-3, 14/14881-1)
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GRIESI-OLIVEIRA, K.; FOGO, M. S.; PINTO, B. G. G.; ALVES, A. Y.; SUZUKI, A. M.; MORALES, A. G.; EZQUINA, S.; SOSA, O. J.; SUTTON, G. J.; SUNAGA-FRANZE, D. Y.; et al. Transcriptome of iPSC-derived neuronal cells reveals a module of co-expressed genes consistently associated with autism spectrum disorder. MOLECULAR PSYCHIATRY, v. 26, n. 5, p. 1589-1605, . (13/08028-1, 16/50324-5, 14/10068-4)
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SCHMITT, ANDREA; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; AKBARIAN, SCHAHRAM; CASSOLI, JULIANA S.; EHRENREICH, HANNELORE; FISCHER, ANDRE; FONTEH, ALFRED; GATTAZ, WAGNER F.; GAWLIK, MICHAEL; GERLACH, MANFRED; et al. Consensus paper of the WFSBP Task Force on Biological Markers: Criteria for biomarkers and endophenotypes of schizophrenia, part III: Molecular mechanisms. WORLD JOURNAL OF BIOLOGICAL PSYCHIATRY, v. 18, n. 5, p. 330-356, . (14/21035-0, 14/10068-4, 14/14881-1, 13/08711-3)
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SANTOS DE OLIVEIRA, PERCILLIA VICTORIA; GARCIA-ROSA, SHEILA; AZEVEDO SACHETTO, ANA TERESA; SOARES MORETTI, ANA IOCHABEL; DEBBAS, VICTOR; DE BESSA, TIPHANY CORALIE; SILVA, NATHALIA TENGUAN; PEREIRA, ALEXANDRE DA COSTA; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; SANTORO, MARCELO LARAMI; et al. Protein disulfide isomerase plasma levels in healthy humans reveal proteomic signatures involved in contrasting endothelial phenotypes. REDOX BIOLOGY, v. 22, . (17/25588-1, 18/07511-4, 17/19866-9, 14/20595-1, 13/08711-3, 13/25177-0, 14/10068-4, 13/07937-8)
AQUINO, ADRIANO; ALEXANDRINO, GUILHERME L.; GUEST, PAUL C.; AUGUSTO, FABIO; GOMES, ALEXANDRE F.; MURGU, MICHAEL; STEINER, JOHANN; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Blood-Based Lipidomics Approach to Evaluate Biomarkers Associated With Response to Olanzapine, Risperidone, and Quetiapine Treatment in Schizophrenia Patients. FRONTIERS IN PSYCHIATRY, v. 9, . (17/25588-1, 15/08201-0, 15/09159-8, 13/08711-3, 14/10068-4)
DAKIC, VANJA; NASCIMENTO, JULIANA MINARDI; SARTORE, RAFAELA COSTA; MACIEL, RENATA DE MORAES; DE ARAUJO, DRAULIO B.; RIBEIRO, SIDARTA; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; REHEN, STEVENS K.. Short term changes in the proteome of human cerebral organoids induced by 5-MeO-DMT. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (14/21035-0, 14/10068-4, 13/08711-3)
DEZONNE, ROMULO SPERDUTO; SARTORE, RAFAELA COSTA; NASCIMENTO, JULIANA MINARDI; SAIA-CEREDA, VERONICA M.; ROMAO, LUCIANA FERREIRA; ALVES-LEON, SONIZA VIEIRA; DE SOUZA, JORGE MARCONDES; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; REHEN, STEVENS KASTRUP; ALCANTARA GOMES, FLVIA CARVALHO. Derivation of Functional Human Astrocytes from Cerebral Organoids. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, . (14/21035-0, 14/10068-4, 13/08711-3, 16/07332-7)
SEABRA, GABRIELA; DE ALMEIDA, VALERIA; REIS-DE-OLIVEIRA, GUILHERME; CRUNFLI, FERNANDA; LEAO MARCELO ANTUNES, ANDRE SARAIVA; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Ubiquitin-proteasome system, lipid metabolism and DNA damage repair are triggered by antipsychotic medication in human oligodendrocytes: implications in schizophrenia. SCIENTIFIC REPORTS, v. 10, n. 1, . (19/22398-2, 17/25588-1, 14/10068-4, 17/18242-1, 19/03271-1, 19/00098-7, 18/03673-0)
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