| Texto completo | |
| Autor(es): |
Silva-Costa, Licia C.
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Garcia-Rosa, Sheila
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Smith, Bradley J.
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Baldasso, Paulo A.
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Steiner, Johann
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Martins-de-Souza, Daniel
Número total de Autores: 6
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| Tipo de documento: | Artigo Científico |
| Fonte: | SEPARATION SCIENCE PLUS; v. 2, n. 12, p. 8-pg., 2019-10-21. |
| Resumo | |
There is a constant interest in blood-based protein biomarkers, which can help to improve diagnosis and treatment outcomes of multifactorial human pathologies. In this regard, proteomic studies usually employ plasma immunoaffinity fractionation to deplete the most abundant plasma proteins, due to the high dynamic concentration range of proteins. The depletion of high abundant proteins allows to obtain less abundant and, oftentimes, more interesting proteins. However, the removal of the fraction of the high abundant plasma proteins - the depletome - may co-elute many unintended proteins due to protein-protein interactions. Little data is available about the depletome and potential protein biomarkers may be lost during this process. To visualize and characterize these proteins, we analyzed the depletome of 20 plasma samples by shotgun mass spectrometry-based proteomics. Thus, using immunoaffinity depletion followed by 2-D liquid chromatography coupled to an ion mobility-enhanced mass spectrometer, our analysis identified that over 100 proteins are co-eluting with the high abundant fraction. These proteins play roles in several biological processes, such as receptor-mediated endocytosis, complement activation, and regulation of immune response. This study supports that investigating the depletome is important in the quest for biomarkers. (AU) | |
| Processo FAPESP: | 16/07948-8 - Papel da fosfodiesterase CNP associada a mielina com a esquizofrenia |
| Beneficiário: | Bradley Joseph Smith |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Processo FAPESP: | 19/05747-3 - A manutenção e a maturação de uma linhagem celular de oligodendrócitos |
| Beneficiário: | Bradley Joseph Smith |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico |
| Processo FAPESP: | 17/25588-1 - Da compreensão básica a biomarcadores clínicos para a esquizofrenia: um estudo multidisciplinar centrado na neuroproteômica |
| Beneficiário: | Daniel Martins-de-Souza |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Temático |
| Processo FAPESP: | 13/08711-3 - Desenvolvimento de um teste preditivo para medicação bem sucedida e compreensão das bases moleculares da esquizofrenia através da proteômica |
| Beneficiário: | Daniel Martins-de-Souza |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores |
| Processo FAPESP: | 18/03422-7 - Identificação de biomarcadores em depressão geriátrica através de análise proteômica |
| Beneficiário: | Licia Carla da Silva Costa |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Mestrado |
| Processo FAPESP: | 14/10068-4 - EMU concedido no processo 13/08711-3: espectrômetro de massas Waters SYNAPT G2-Si HDMs + nanoACQUITY UPLC |
| Beneficiário: | Daniel Martins-de-Souza |
| Modalidade de apoio: | Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários |