COVID-19 vaccination atlas using an integrative systems vaccinology approach

Autor(es):Mostrar menos -

Prates-Syed, Wasim Aluisio ; Fonseca, Dennyson Leandro Mathias da ; Pour, Shahab Zaki ; Lira, Aline ; Cortes, Nelson ; Silva, Jaqueline Dinis Queiroz ; Carvalho, Evelyn ; Filgueiras, Igor Salerno ; Vinces, Tania Geraldine Churascari ; Schimke, Lena F. ; Chaves, Lorena C. S. ; Wunderlich, Gerhard ; Duraes-Carvalho, Ricardo ; Dias, Haroldo Dutra ; Ochs, Hans D. ; Camara, Niels O. S. ; Nakaya, Helder I. ; Krieger, Jose E. ; Cabral-Marques, Otavio ; Cabral-Miranda, Gustavo

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: NPJ VACCINES; v. 10, n. 1, p. 12-pg., 2025-06-02.

Resumo

The COVID-19 vaccinations have played a significant role in controlling the pandemic. To elucidate their impact on the immune system, a COVID-19 vaccination atlas was developed using an integrative systems vaccinology approach. The atlas includes 562 samples from 245 participants, including both healthy individuals and those infected with or without prior vaccination, and covers the administration of five vaccines in different regimens. Key findings include the identification of distinct immune markers that differentiate between vaccine types and infection statuses. We observed that mRNA vaccines induced transient but strong immune responses after booster doses, whereas viral vector vaccines showed sustained immune activation with infection, partially resembling the immune profile exhibited during infection. Heterologous vaccination regimens demonstrated enhanced immune diversification compared to homologous regimens. Finally, we described the immunological landscape of COVID-19 vaccines and vaccines against other pathogens, at the gene-level and in cell population dynamics. (AU)

• Processo FAPESP: 18/18886-9 - Análise sistêmica e integrativa da resposta imune às infecções virais por Zika e Dengue
• Beneficiário: Otávio Cabral Marques
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 23/07806-2 - Fundamentação bioinformática das análises sistêmicas e integrativas de infecções virais.
• Beneficiário: Igor Salerno Filgueiras
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Processo FAPESP: 19/01255-9 - Morcegos: vigilância epidemiológica, filodinâmica de alta resolução, busca e design de peptídeos de interesse biotecnológico em vírus emergentes e reemergentes
• Beneficiário: Ricardo Durães de Carvalho
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 19/14526-0 - Desenvolvimento de vacinas contra Streptococcus pyogenes e Chikungunya utilizando VLPs
• Beneficiário: Gustavo Cabral de Miranda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 21/03684-4 - Morcegos: vigilância epidemiológica, filodinâmica de alta resolução, busca e design de peptídeos de interesse biotecnológico em vírus emergentes e reemergentes
• Beneficiário: Ricardo Durães de Carvalho
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Processo FAPESP: 20/16246-2 - Caracterização holística do mecanismo de exaustão dos linfócitos T em pacientes com Zika
• Beneficiário: Dennyson Leandro Mathias da Fonseca
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 23/13356-0 - A análise de autoanticorpos ativadores de neutrófilos: uma perspectiva de trombose
• Beneficiário: Dennyson Leandro Mathias da Fonseca
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado Direto
• Processo FAPESP: 20/05146-7 - Desenvolvimento de vacina anti-SARS-CoV-2 utilizando VLPs
• Beneficiário: Gustavo Cabral de Miranda
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular