Uncovering false positives on a virtual screening search for cruzain inhibitors

Autor(es)

Ferreira, Elizabeth Igne ^[1] ; Malvezzi, Alberto ; Rezende, Leandro de ; Izidoro, Mario Augusto ; Cezari, Maria Helena Sedenho ; Juliano, Luiz ; Amaral, Antonia T. -do

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Ciências Farmacêuticas. Departamento de Farmácia - Brasil

• Tipo de documento: Artigo Científico
• Fonte: Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters; v. 18, n. 1, p. 350-354, Jan. 2008.
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Assunto(s): Inibidores enzimáticos Cisteína Proteínas de protozoários

Resumo

Some unexpected promiscuous inhibitors were observed in a virtual screening protocol applied to select cruzain inhibitors from the ZINC database. Physical-chemical and pharmacophore model filters were used to reduce the database size. The selected compounds were docked into the cruzain active site. Six hit compounds were tested as inhibitors. Although the compounds were designed to be nucleophilically attacked by the catalytic cysteine of cruzain, three of them showed typical promiscuous behavior, revealing that false positives are a prevalent concern in VS programs. Graphical abstract: Promiscuous inhibition of cruzain is reported for three out of six virtual screening selected compounds. The promiscuous mechanism was assumed after the recovery of the enzyme activity following the addition of 0.1% Triton. (AU)

• Processo FAPESP: 02/09518-8 - Relações quantitativas entre estrutura química e atividade biológica (QSAR/QSAR-ED) de compostos antichagásicos
• Beneficiário: Alberto Malvezzi
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 01/01192-3 - Antichagásicos potenciais derivados de compostos nitro-heterocíclicos
• Beneficiário: Elizabeth Igne Ferreira
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Temático
• Processo FAPESP: 04/08928-3 - Desenvolvimento e aplicação de métodos computacionais de alto desempenho para análise de sistemas físicos e biológicos
• Beneficiário: Luiz Nunes de Oliveira
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários