Mass spectrometry in plant metabolomics strategies: from analytical platforms to data acquisition and processing

Autor(es)

Ernst, Madeleine ^[1] ; Silva, Denise Brentan ^[1] ; Silva, Ricardo Roberto ^[2] ; Vencio, Ricardo Z. N. ^[2] ; Lopes, Norberto Peporine ^[1]

Afiliação do(s) autor(es)

^[1] Univ Sao Paulo, Fac Pharmaceut Sci, Dept Chem & Phys, Nucleo Pesquisa Prod Na & Sintet, BR-14040903 Ribeirao Preto, SP - Brazil

^[2] Univ Sao Paulo, FFCLRP, Dept Comp & Math, BR-14040901 Ribeirao Preto, SP - Brazil

• Tipo de documento: Artigo de Revisão
• Fonte: NATURAL PRODUCT REPORTS; v. 31, n. 6, p. 784-806, 2014.
• Citações Web of Science: 76

Resumo

Plant metabolomics is a relatively recent research field that has gained increasing interest in the past few years. Up to the present day numerous review articles and guide books on the subject have been published. This review article focuses on the current applications and limitations of the modern mass spectrometry techniques, especially in combination with electrospray ionisation (ESI), an ionisation method which is most commonly applied in metabolomics studies. As a possible alternative to ESI, perspectives on matrix-assisted laser desorption/ionisation mass spectrometry (MALDI-MS) in metabolomics studies are introduced, a method which still is not widespread in the field. In metabolomics studies the results must always be interpreted in the context of the applied sampling procedures as well as data analysis. Different sampling strategies are introduced and the importance of data analysis is illustrated in the example of metabolic network modelling. (AU)

• Processo FAPESP: 11/05215-0 - Metabolômica como ferramenta em sistemática: o modelo em arnica
• Beneficiário: Madeleine Ernst
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Processo FAPESP: 10/14926-4 - Bioinformática aplicada à Bioenergia: anotação probabilística do metaboloma da cana-de-açúcar
• Beneficiário: Ricardo Roberto da Silva
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Processo FAPESP: 12/18031-7 - Aplicação de MALDI-MS/MS na análise da vicenina-2 e correlatos: da compreensão dos processos ionizantes à geração de imagens
• Beneficiário: Denise Brentan da Silva
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Processo FAPESP: 09/54098-6 - EMU: aquisição de um espectrômetro de massas para geração de imagens na Central de Espectrometria de Massas (mass-facility) da FCFRP-USP: estudos de localização molecular de substâncias biologicamente ativas
• Beneficiário: Norberto Peporine Lopes
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários