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STUDY OF REPETITIVE DNA IN THE GENUS EIGENMANNIA (TELEOSTEI: GYMNOTIFORMES)

Grant number: 09/00561-7
Support Opportunities:Scholarships in Brazil - Doctorate
Start date: September 01, 2009
End date: April 30, 2013
Field of knowledge:Biological Sciences - Genetics - Animal Genetics
Principal Investigator:Lurdes Foresti de Almeida-Toledo
Grantee:Felippe Lourenço Claro
Host Institution: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brazil

Abstract

O DNA repetitivo constitui uma fração considerável do genoma de muitos organismos eucarióticos. Composto tanto por seqüências funcionais, como os genes ribossômicos, quanto não codificantes, como é o caso dos elementos transponíveis, mini/microssatélites e o DNA satélite, essa porção do genoma tem sido amplamente utilizada como objeto de estudo, uma vez que seqüências repetitivas podem estar associadas a cromossomos sexuais e a blocos heterocromáticos em geral. Esses estudos têm auxiliado tanto na melhor compreensão da dinâmica dessas regiões cromossômicas, como salientado a importância, a conservação e a evolução da porção repetitiva no genoma. O gênero Eigenmannia (Gymnotiformes, Sternopygidae) compreende espécies crípticas do ponto de vista morfológico que exibem variação no número cromossômico e podem apresentar sistemas sexuais XY ou ZW nos quais os elementos do par sexual diferem pela presença de blocos heterocromáticos maiores do que os encontrados em cromossomos autossomos, ou sistemas múltiplos envolvendo translocação Y-autossomo. O presente trabalho tem por objetivos dar continuidade aos estudos sobre o DNA repetitivo no gênero Eigenmannia, focalizando agora possíveis marcadores citogenéticos e moleculares, estando ou não ligados a cromossomos sexuais e a regiões heterocromáticas, permitindo uma melhor compreensão da dinâmica dessa porção do genoma nesse grupo. Será ainda feita a identificação, localização e seqüenciamento de elementos transponíveis, com a finalidade de obter uma melhor compreensão sobre a distribuição e a conservação desses elementos e verificar sua possível relação com a diferenciação dos cromossomos sexuais e regiões heterocromáticas. A associação de elementos do tipo SINE ao rDNA 5S será analisada para melhor compreensão da dinâmica evolutiva dessa família multigênica no gênero Eigenmannia.

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Academic Publications
(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)
CLARO, Felippe Lourenço. Studies of repetitive DNA in the genus Eigenmannia. 2013. Doctoral Thesis - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.