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Navscales: navigating through scales in space, time and knowledge domains

Grant number: 13/02219-0
Support Opportunities:Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
Start date: March 01, 2013
End date: February 28, 2015
Field of knowledge:Biological Sciences - Zoology
Agreement: Microsoft Research
Principal Investigator:Luis Felipe de Toledo Ramos Pereira
Grantee:Leandro Tacioli
Host Institution: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brazil
Company:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação (IC)
Associated research grant:11/52070-7 - NavScales: navigating through scales in space, time and domains of knowledge , AP.PITE

Abstract

A pesquisa em mudanças climáticas requer que sejam consideradas interações complexas em múltiplas escalas, que variam da granularidade micro (bactérias) até a macro (o planeta). Para que se possa explorar de forma adequada a evolução e interação de tais sistemas, grupos de pesquisa (e as várias disciplinas envolvidas) precisam considerar entidades diferentes de estudo, que são submetidas a dinâmicas específicas no espaço e no tempo. Isto apresenta um grande conjunto de novos desafios no gerenciamento de informação espaço-temporal, e na colaboração entre domínios do conhecimento. O objetivo deste projeto é atacar alguns desses desafios, propondo algoritmos e ferramentas de software que permitam a cientistas a "navegação" por dados em múltiplas escalas, e a "navegação" na literatura científica em vários domínios. Para isto, o projeto irá explorar soluções que envolvem conceitos associados com bancos de dados espaço-temporais e versionamento em bancos de dados, e também a Web Semântica, em especial ontologias e "linked data". Tendo em vista a grande gama de problemas a serem tratados, partiremos de soluções iniciais que estamos desenvolvendo na UNICAMP. Além dos mecanismos padrão de disseminação, iremos utilizar nosso projeto WebLectures para produzir e disseminar material didático associado, na Web. Resultados serão validados com dois estudos de caso, em agricultura e biodiversidade. A equipe componente (3 cientistas da computação, um biólogo, um engenheiro agrícola) já tem histórico de cooperação, com publicações conjuntas e co-orientação de alunos. (AU)

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Scientific publications
(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)
FORTI, LUCAS R.; COSTA, WILLIAM P.; MARTINS, LUCAS B.; NUNES-DE-ALMEIDA, CARLOS H. L.; TOLEDO, LUIS FELIPE. Advertisement call and genetic structure conservatism: good news for an endangered Neotropical frog. PeerJ, v. 4, . (14/23388-7, 13/02219-0, 13/21519-4, 13/09964-2)
FORTI, LUCAS RODRIGUEZ; BECKER, C. GUILHERME; TACIOLI, LEANDRO; PEREIRA, VANIA ROSA; SANTOS, ANDRE CID F. A.; OLIVEIRA, IGOR; HADDAD, CELIO F. B.; TOLEDO, LUIS FELIPE. Perspectives on invasive amphibians in Brazil. PLoS One, v. 12, n. 9, . (13/21519-4, 11/51694-7, 14/50342-8, 11/52070-7, 14/23388-7, 13/50741-7, 13/02219-0)