Water filtration and DNA extraction protocol enhancement for environmental DNA studies

• Grant number: 22/14144-3
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: November 01, 2022
• End date: February 28, 2023
• Field of knowledge: Agronomical Sciences - Fishery Resources and Fishery Engineering - Inland Water Fishery Resources
• Principal Investigator: André Batista Nobile
• Grantee: Lucas Fortino Lasmar
• CNAE: Pesquisa e desenvolvimento experimental em ciências físicas e naturais ; Atividades profissionais, científicas e técnicas não especificadas anteriormente
• Associated research grant: 21/13994-0 - Development and application of an environmental DNA protocol (e-DNA) as a fast, accurate and non-invasive method for monitoring freshwater ichthyofauna, AP.PIPE

Abstract

Embora a técnica de DNA ambiental esteja em estágio avançado em países de clima temperado, na região Neotropical, esta técnica ainda se encontra em fase de estabelecimento de protocolo. Uma das maiores dificuldades nesta linha de pesquisaé a obtenção de amostras de qualidade, que contenham DNA suficiente e de boa qualidade. Sendo assim, o bolsista irá atuar nas fases iniciais do projeto, realizando a filtragem de água e coleta de sedimento em diferentes quantidades, bem como, irá atuar na extração de DNA provindo destas amostras, a fim de se obter a concentração necessária para as fases seguintes: amplificação, montagem de biblioteca e sequenciamento.