Standardization and optimization of nucleic acid extraction protocols

• Grant number: 24/00183-2
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: March 01, 2024
• End date: November 30, 2024
• Field of knowledge: Biological Sciences - Genetics - Plant Genetics
• Principal Investigator: Fernando de Faria Franco
• Grantee: Milena Sviatek Ribeiro Rocha
• Host Institution: Centro de Ciências Humanas e Biológicas (CCHB). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba , SP, Brazil
• Associated research grant: 20/15161-3 - Adaptation during biogeographic transitions from the Cerrado to the Caatinga: evolutionary parallelism and idiosyncrasies in independent clades of genus Cereus (Cactaceae), AP.BTA.R

Abstract

Tecidos vegetais ricos em polissacarídeos são desafiadores para extração de ácidos nucleicos de qualidade. Neste contexto, trabalhos de padronização e otimização de protocolos são comuns em genética vegetal, sobretudo com o advento dos métodos de sequenciamento de nova geração. Esse tipo de padronização pode envolver diferentes dimensões (tecidos, reagentes etc), exigindo um esforço contínuo do grupo de pesquisa. O/A bolsista TT-2 realizará extrações de DNA e RNA, de diferentes tecidos (epiderme, raiz e espinhos) de modo a padronizar para cada tecido o procedimento mais adequado ao nosso grupo de pesquisa.