Application of environmental DNA metabarcoding in protected and non-protected marine areas of the State of São Paulo.

• Grant number: 24/05452-1
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: July 01, 2024
• End date: June 30, 2026
• Field of knowledge: Physical Sciences and Mathematics - Oceanography - Biological Oceanography
• Principal Investigator: Rodrigo Rodrigues Domingues
• Grantee: Luiza Ferreira Soares
• Host Institution: Instituto Oceanográfico (IO). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brazil
• Associated research grant: 19/10201-0 - Marine biodiversity: an exploration of São Paulo coastal islands using environmental DNA metabarcoding, AP.BTA.JP

Abstract

A bolsa TTT3 em tela esta associada ao projeto Jovem Pesquisador - FAPESP "Biodiversidade marinha: uma exploração das ilhas costeiras de São Paulo usando DNA ambiental metabarcoding", que objetiva descrever pela primeira vez a biodiversidade eucariótica, por meio do DNA ambiental, de quatro ilhas costeiras de São Paulo, sendo duas delas dentro de áreas marinhas protegidas (Arquipélago de Alcatrazes e Parque Estadual Marinho da Laje de Santos) e duas em áreas não protegidas (Ilhas de Búzios - Ilha Bela e Ilha da Queimada Grande). Nesse contexto, a bolsista de treinamento técnico nível III auxiliará nos trabalhos de campo, desde a organização até as coletas de água e dados oceanográficos e filtragem da água. Será responsável pelas atividades laboratoriais, como preparação de reagentes, descontaminação de bancada, extrações do DNA ambiental, checagem da integridade do DNA através de gel de agarose em eletroforese e quantificação fluorométrica usando o Qubit. Também realizará a amplificação das regiões genéticas (COI, 18s, 12s) através de PCR e auxilio nas montagens de bibliotecas e envio das amostras para sequenciamento. A bolsista também auxiliará nas compras de insumos necessários para o desenvolvimento da pesquisa e fará a organização e curadoria da coleção de tecidos do LAGEM. Ao final de sua bolsa, espera-se que essas atividades proporcionem à bolsista experiência de campo, em trabalhos de bancada de biologia molecular, além do desenvolvimento e gestão de projetos, enriquecendo suas habilidades profissionais.