Single cell analysis of cell subpopulations and their dynamics in the ventral prostate after castration

• Grant number: 25/13087-4
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: August 01, 2025
• End date: November 02, 2025
• Field of knowledge: Biological Sciences - Morphology - Cytology and Cell Biology
• Principal Investigator: Hernandes Faustino de Carvalho
• Grantee: Francisco Breno Silva Teófilo
• Host Institution: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brazil
• Associated research grant: 21/02303-7 - Single cell analyses and non-linear optics approaches of prostate biology, AP.TEM

Abstract

Este projeto visa aplicar técnicas complexas de transcriptoma de célula única para investigar a dinâmica de diferentes tipos celulares que compõem o microambiente da próstata ventral de ratos em resposta à castração cirúrgica. Animais, na idade adulta, serão castrados e suas células isoladas em um fluxo de trabalho que integra o uso de coquetéis enzimáticos e centrifugações para remoção da componentes da matriz extracelular, hemácias e debris celulares. As células isoladas serão capturadas para formação de gotículas em emulsão, de acordo com protocolo específico recomendado para a tecnologia Chromium da 10X Genomics. Na sequência, o material será preparado para sequenciamento em um sistema Illumina. Os dados brutos serão convertidos em arquivos fastq e processados por ferramentas de bioinformática em etapas que incluem o controle de qualidade, anotações dos tipos celulares, clusterização e interpretação biológica.