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Uso de genotipagem-por-sequenciamento (GBS) para a identificação de marcadores moleculares SNP (single nucleotide polymorphism) e construção de mapa de ligação em Hevea brasiliensis

Processo: 14/11807-5
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Mestrado
Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2014
Data de Término da vigência: 29 de fevereiro de 2016
Área de conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Luciano Henrique Braz dos Santos
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Genética estatística   Biologia computacional   Técnicas de genotipagem   Seringueira   Hevea
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Genotipagem-por-sequenciamento | hevea | Hevea brasiliensis | Mapa de ligação | Snp | Genética Estatística / Bioinformática

Resumo

A seringueira, espécie originária da Amazônia, apresenta grande importância econômica, sendo a maior fonte de borracha natural do mundo, a qual serve como matéria-prima para os mais diversificados produtos, dentre os quais se destacam produtos utilizados no ambiente hospitalar e pneus. Possuindo grande área plantada em todo o mundo, cerca de 95% destas áreas utilizam clones que são originários de 5 a 10 árvores primárias, dependendo assim de uma estreita base genética. Por possuir um longo ciclo de melhoramento de cerca de 30 anos, o emprego de novas técnicas pode representar numa diminuição deste tempo. Neste contexto, surgem os marcadores moleculares SNPs (single nucleotide polymorphism), que podem auxiliar programas de melhoramento genético de seringueira. Neste contexto o uso de uma técnica recentemente descrita, conhecida como genotipagem-por-sequenciamento (GBS), permite a descoberta de SNPs em grande quantidade e, através destes dados, é possível obter mapas genéticos de grande resolução que podem auxiliar na descoberta de regiões cromossômicas que controlam caracteres com padrão contínuo de variação fenotípica, conhecidas como QTLs (Quantitative Trait Loci). (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CONSON, ANDRE R. O.; TANIGUTI, CRISTIANE H.; AMADEU, RODRIGO R.; ANDREOTTI, ISABELA A. A.; DE SOUZA, LIVIA M.; DOS SANTOS, LUCIANO H. B.; ROSA, JOAO R. B. F.; MANTELLO, CAMILA C.; DA SILVA, CARLA C.; SCALOPPI JUNIOR, ERIVALDO JOSE; et al. High-Resolution Genetic Map and QTL Analysis of Growth-Related Traits of Hevea brasiliensis Cultivated Under Suboptimal Temperature and Humidity Conditions. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, . (07/50392-1, 15/24346-9, 12/50491-8, 11/50188-0, 09/52975-0, 14/11807-5, 12/05473-1, 17/07908-9, 14/18755-0)
DE SOUZA, LIVIA M.; DOS SANTOS, LUCIANO H. B.; ROSA, JOAO R. B. F.; DA SILVA, CARLA C.; MANTELLO, CAMILA C.; CONSON, ANDRE R. O.; SCALOPPI, JR., ERIVALDO J.; FIALHO, JOSEFINO DE F.; DE MORAES, MARIO LUIZ T.; GONCALVES, PAULO DE S.; et al. Linkage Disequilibrium and Population Structure in Wild and Cultivated Populations of Rubber Tree (Hevea brasiliensis). FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 9, . (12/50491-8, 11/50188-0, 14/11807-5, 17/07908-9, 09/52975-0, 14/18755-0, 12/05473-1, 07/50392-1)