Busca por proteínas associadas à cromatina e padrões de MPTs de histonas associados a estágios celulares e estados metabólicos em tripanossomas

Resumo

Parasitas submetidos a diferentes contextos metabólicos, como estresse metabólico grave ou condições de estresse metabólico na presença de fontes únicas de carbono e energia para manutenção (PBS suplementado com glicose, prolina, histidina ou leucina) podem ter epigenomos diferentes. Essas diferenças podem afetar o ciclo celular, diferenciação ou invasão de células hospedeiras entre outros processos. Nesta proposta, avaliaremos o epigenoma de parasitas mantidos em diferentes condições metabólicas. Usando um pipeline de ponta para análise de histone PTM, esperamos obter um grande conjunto de dados de medidas quantitativas nos cenários mencionados acima. Os PTMs nas proteínas associadas à cromatina também serão obtidos. Após uma intensa análise de dados, que inclui a integração dos dois conjuntos de dados proteômicos gerados, será possível identificar os principais marcadores epigenéticos associados aos estados metabólicos ou ao ciclo celular. Em seguida, escolheremos alvos para explorar melhor seu papel putativo. Finalmente, a função biológica alvo será explorada avaliando-se: localização genômica, localização celular e dinâmica da expressão. (AU)