Caracterização global do perfil de expressão gênica dos estágios inicial e avançado do melanoma e análise funcional de candidatos a supressor de tumor ou oncogênese: consolidando ferramentas e dados revelados em estudos prévios

• Processo: 06/60328-6
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Programa Primeiros Projetos
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2007
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2008
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
• Acordo de Cooperação: CNPq - Programa Primeiros Projetos
• Pesquisador responsável: Josane de Freitas Sousa
• Beneficiário: Josane de Freitas Sousa
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Assunto(s): Melanoma Expressão gênica Análise de sequência com séries de oligonucleotídeos Oncogenes Progressão tumoral
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Expressao Diferencial | Interferencia Funcional | Melanoma | Progressao Tumoral | Silenciamento Genico | Superxpressao Genica

Resumo

Dados prévios, resultantes da utilização de microarranjos contendo ESTs (ORESTES) que mapeiam em regiões cromossômicas associadas ao desenvolvimento do melanoma, revelaram 4 novos genes com potencial envolvimento na progressão tumoral. Além disso, foram geradas duas bibliotecas subtrativas, cuja análise inicial (20% dos clones) revelou representarem duas grandes coleções de genes com marcante expressão diferencial entre os estágios de crescimento radial e metastático do melanoma. Assim, pretendemos definir e caracterizar o papel de novos genes no desenvolvimento do melanoma a partir da utilização e análise dos dados de expressão gênica diferencial já obtidos. Para isso propomos: 1. sequenciar completamente as bibliotecas subtrativas, 2. realizar análises in silico das sequências para definição de novos genes candidatos, 3. confirmar por Northern blotting e Real-Time RT-PCR, o perfil de expressão diferencial dos genes candidatos selecionados, 4. causar interferência funcional, através da técnica de RNAi sobre os genes selecionados. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SOUSA, JOSANE F.; TORRIERI, RAUL; SILVA, RODRIGO R.; PEREIRA, CRISTIANO G.; VALENTE, VALERIA; TORRIERI, ERICO; PERONNI, KAMILA C.; MARTINS, WALESKA; MUTO, NAIR; FRANCISCO, GUILHERME; et al. Novel Primate-Specific Genes, RMEL 1, 2 and 3, with Highly Restricted Expression in Melanoma, Assessed by New Data Mining Tool. PLoS One, v. 5, n. 10, OCT 20 2010. (07/50604-9, 06/60328-6, 08/56521-0, 05/60026-7, 07/57307-0)