Estudos estruturais acerca do trocador de Na+/Ca2+ e de proteínas do vírus Zika por espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear em solução

• Processo: 16/07490-1
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Regular
• Data de Início da vigência: 01 de setembro de 2016
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2018
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Roberto Kopke Salinas
• Beneficiário: Roberto Kopke Salinas
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Pesquisadores associados: Simona Tomaselli
• Assunto(s): Vírus Zika Ressonância magnética nuclear
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Ca2+ | Ressonância Magnética Nuclear | RMN de proteínas | Trocador de Na+ | Zika vírus | Biologia Estutural

Resumo

O objetivo deste projeto de pesquisa é dar continuidade a estudos estruturais e mecanísticos acerca do trocador de Na+/Ca2+ (NCX) utilizando para isso Ressonância Magnética Nuclear (RMN) em solução. O NCX é um dos principais mecanismos de extrusão de Ca2+ intracelular em células cardíacas. Além de transportar Na+ e Ca2+, o NCX também é regulado por estes íons. O NCX é uma proteína grande, com cerca de 950 amino ácidos que formam um grande domínio transmembranar, domínios citosólicos e regiões desordenadas. Este caráter multifacetado faz com que a caracterização estrutural do NCX seja uma tarefa difícil. Com base em estudos de RMN dos domínios solúveis do NCX de Drosophila melanogaster, CALX, propusemos um modelo para o mecanismo de regulação alosterica do NCX e do CALX (Abiko et al. (2016) Proteins. doi:10.1002/prot.25003). Esta proposta pretende dar continuidade a estes estudos, e iniciar a caracterização estrutural das porções transmembranares necessária para testar diferentes aspectos do modelo. Além disso, pretende-se estudar proteínas do vírus da Zika que desempenham papel essencial nos mecanismos de entrada e replicação do vírus nas células. As proteínas de interesse são a glicoproteína do envelope (E), a proteína NS1 que interage com o sistema imune, e NS2B-NS3pro, a protease do vírus. Se houver tempo, pretende-se utilizar técnicas de transferência de saturação (STD) para testar diferentes ligantes que possam funcionar como inibidores de entrada do vírus ou replicação. Espera-se que estes estudos contribuam para uma maior compreensão da biologia e patogenicidade deste vírus, e para o desenvolvimento de drogas antivirais de amplo espectro no futuro. (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CARDOSO, MARCUS V. C.; RIVERA, JOSE D.; VITALE, PHELIPE A. M.; DEGENHARDT, MAXIMILIA F. S.; ABIKO, LAYARA A.; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; SALINAS, ROBERTO K.. CALX-CBD1 Ca2+-Binding Cooperativity Studied by NMR Spectroscopy and ITC with Bayesian Statistics. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 119, n. 2, p. 337-348, JUL 21 2020. (09/53989-4, 18/21450-8, 17/05614-8, 16/17375-5, 16/07490-1, 17/06394-1)

V.V. DE SOUZA; P.A.M. VITALE; F.H. FLORENZANO; R.K. SALINAS; I.M. CUCCOVIA. A novel method for DNA delivery into bacteria using cationic copolymers. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, v. 54, n. 5, 2021-04-02. (17/05614-8, 16/07490-1, 13/08166-5)

DE SOUZA DEGENHARDT, MAXIMILIA F.; VITALE, PHELIPE A. M.; ABIKO, LAYARA A.; ZACHARIAS, MARTIN; SATTLER, MICHAEL; OLIVEIRA, CRISTIANO L. P.; SALINAS, ROBERTO K.. Molecular insights on CALX-CBD12 interdomain dynamics from MD simulations, RDCs, and SAXS. BIOPHYSICAL JOURNAL, v. 120, n. 17, p. 3664-3675, SEP 7 2021. (18/16092-5, 16/24531-3, 19/19968-1, 17/05614-8, 16/07490-1)

DAMASCENO, TICIANE F.; DIAS, RENATA O.; DE OLIVEIRA, JULIANA R.; SALINAS, ROBERTO K.; JULIANO, MARIA A.; FERREIRA, CLELIA; TERRA, WALTER R.. Active subsite properties, subsite residues and targeting to lysosomes or midgut lumen of cathepsins L from the beetle Tenebrio molitor. Insect Biochemistry and Molecular Biology, v. 89, p. 17-30, OCT 2017. (15/19541-7, 16/07490-1, 11/51685-8)

SARAIVA, G. K. V.; DE SOUZA, V. V.; COUTINHO DE OLIVEIRA, L.; NORONHA, M. L. C.; MASINI, J. C.; CHAIMOVICH, H.; SALINAS, R. K.; FLORENZANO, F. H.; CUCCOVIA, I. M.. Characterization of PMMA-b-PDMAEMA aggregates in aqueous solutions. COLLOID AND POLYMER SCIENCE, v. 297, n. 4, p. 557-569, APR 2019. (13/08166-5, 16/07490-1)

SANZ, MIRIAM; SALINAS, ROBERTO KOPKE; PINTO, ERNANI. Namalides B and C and Spumigins K-N from the Cultured Freshwater Cyanobacterium Sphaerospermopsis torques-reginae. Journal of Natural Products, v. 80, n. 9, p. 2492-2501, SEP 2017. (14/50420-9, 12/25272-0, 16/07490-1)