Caracterização molecular, filogenia e evolução de vírus transmitidos por ácaros Brevipalpus spp. no Brasil

• Processo: 16/01960-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2016
• Data de Término da vigência: 26 de outubro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitossanidade
• Pesquisador responsável: Juliana de Freitas Astúa
• Beneficiário: Camila Chabi de Jesus
• Instituição Sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/08458-9 - Vírus de plantas transmitidos por Brevipalpus (Acari: Tenuipalpidae) - VTB: levantamento, identificação, caracterização molecular, filogenia; relações vírus/vetor/hospedeira; biologia, taxonomia e manejo do vetor, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 19/08186-2 - Filodinâmica do citrus leprosis virus C nas Américas: origem, diversificação e dispersão do principal agente causal da leprose dos citros, BE.EP.DR
• Assunto(s): Ácaros parasitos de plantas Brevipalpus Vírus de plantas Dichorhavirus Variação genética Sequenciamento de nova geração
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cilevirus | Dichorhavirus | leprose dos citros | Next Generation Sequencing | Variabilidade Genética | vírus transmitidos por ácaros | Virologia vegetal

Resumo

Acredita-se que o Brasil é o centro de diversidade de vírus transmitidos por ácaros dogênero Brevipalpus (VTB). Alguns desses VTB infectam culturas fundamentais para oagronégocio brasileiro como citros, café e maracujá, além de várias plantas ornamentais.Na última década os genomas de três deles, Citrus leprosis virus C (CiLV-C), Orchidfleck virus (OFV) e Coffe ringspot virus (CoRSV) foram descritos, mas ainda é escassoo conhecimento sobre os genomas de outros VTB e dos processos evolutivos inerentesàs populações das espécies já conhecidas. Objetiva-se neste projeto caracterizar adiversidade genética dos VTB no Brasil, establecer suas relações filogenéticas e revelaras forças envolvidas na evolução de CiLV-C, o VTB melhor estudado até o momento.Para tanto, folhas de plantas hospedeiras de VTB com sintomas característicos serãocoletadas e, a partir de seu RNA total e mediante tecnologia NGS serão obtidos osgenomas virais. Para o estudo da história evolutiva de CiLV-C, agente causal da leprosedos citros, serão utilizadas amostras de citros e Commelina benghalensis com sintomasda doença de diferentes épocas: 1935 (a partir de amostras de citros mantidas noherbário do Instituto Biológico de São Paulo), 2006-2014 e 2016-2017. Após osequenciamento e montagem dos genomas, as sequências obtidas serão analisadasutilizando pacotes bioinformáticos específicos para estudos de população. Assequências de CiLV-C recuperadas serão comparadas com genomas virais das amostrasatuais, procurando compreender a epidemiologia molecular deste vírus. Do ponto devista prático o presente projeto pode contribuir com o desenvolvimento de ferramentasde diagnósticos moleculares e a geração de informação necessária para o manejo econtrole das doenças causadas pelos VTB estudados. (AU)

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; DA COSTA-RODRIGUES, MARIANE; POTSCLAM-BARRO, MATHEUS; CHABI-JESUS, CAMILA; BANGUELA-CASTILLO, ALEXANDER; HARAKAVA, RICARDO; KITAJIMA, ELLIOT W.; FREITAS-ASTUA, JULIANA. First genome sequence of an isolate of hibiscus chlorotic ringspot virus from the Western hemisphere. TROPICAL PLANT PATHOLOGY, v. 45, n. 2, FEB 2020. (14/08458-9, 17/50222-0, 17/50334-3, 19/09222-2, 16/01960-6)

RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; CHABI-JESUS, CAMILA; BANGUELA-CASTILLO, ALEXANDER; TASSI, ALINE DANIELE; RODRIGUES, MARIANE DA COSTA; KITAJIMA, ELLIOT WATANABE; HARAKAVA, RICARDO; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Unveiling the complete genome sequence of clerodendrum chlorotic spot virus, a putative dichorhavirus infecting ornamental plants. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 163, n. 9, p. 2519-2524, SEP 2018. (13/25713-0, 16/01960-6, 14/08458-9)

RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; CHABI-JESUS, CAMILA; GUERRA-PERAZA, ORLENE; TASSI, ALINE DANIELE; KITAJIMA, ELLIOT WATANABE; HARAKAVA, RICARDO; SALAROLI, RENATO BARBOSA; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Citrus leprosis virus N: A New Dichorhavirus Causing Citrus Leprosis Disease. PHYTOPATHOLOGY, v. 107, n. 8, p. 963-976, AUG 2017. (16/01960-6, 14/08458-9)

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RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; DA COSTA-RODRIGUES, MARIANE; POTSCLAM-BARRO, MATHEUS; CHABI-JESUS, CAMILA; BANGUELA-CASTILLO, ALEXANDER; HARAKAVA, RICARDO; KITAJIMA, ELLIOT W.; FREITAS-ASTUA, JULIANA. First genome sequence of an isolate of hibiscus chlorotic ringspot virus from the Western hemisphere. ROPICAL PLANT PATHOLOG, v. 45, n. 2, p. 6-pg., 2020-02-05. (17/50334-3, 14/08458-9, 17/50222-0, 16/01960-6, 19/09222-2)

RAMOS-GONZALEZ, PEDRO LUIS; DOS SANTOS, GUSTAVO FRANCISCO; CHABI-JESUS, CAMILA; HARAKAVA, RICARDO; KITAJIMA, ELLIOT W.; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Passion Fruit Green Spot Virus Genome Harbors a New Orphan ORF and Highlights the Flexibility of the 5 `-End of the RNA2 Segment Across Cileviruses. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 11, FEB 14 2020. (14/08458-9, 17/50222-0, 17/50334-3, 16/01960-6)

CHABI-JESUS, C.; RAMOS-GONZALEZ, P. L.; TASSI, A. D.; GUERRA-PERAZA, O.; KITAJIMA, E. W.; HARAKAVA, R.; BESERRA, JR., J. E. A.; SALAROLI, R. B.; FREITAS-ASTUA, J.. Identification and Characterization of Citrus Chlorotic Spot Virus, a New Dichorhavirus Associated with Citrus Leprosis-Like Symptoms. PLANT DISEASE, v. 102, n. 8, p. 1588-1598, AUG 2018. (16/01960-6, 14/08458-9)

AMARASINGHE, GAYA K.; AYLLON, MARIA A.; BAO, YIMING; BASLER, CHRISTOPHER F.; BAVARI, SINA; BLASDELL, KIM R.; BRIESE, THOMAS; BROWN, PAUL A.; BUKREYEV, ALEXANDER; BALKEMA-BUSCHMANN, ANNE; et al. Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2019. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 164, n. 7, p. 1967-1980, JUL 2019. (16/01960-6, 17/50222-0, 14/08458-9)

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CHABI-JESUS, CAMILA; RAMOS-GONZALEZ, PEDRO L.; POSTCLAM-BARRO, MATHEUS; FONTENELE, RAFAELA SALGADO; HARAKAVA, RICARDO; BASSANEZI, RENATO B.; MOREIRA, ALECIO S.; KITAJIMA, ELLIOT W.; VARSANI, ARVIND; FREITAS-ASTUA, JULIANA. Molecular Epidemiology of Citrus Leprosis Virus C: A New Viral Lineage and Phylodynamic of the Main Viral Subpopulations in the Americas. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 12, APR 29 2021. (16/01960-6, 17/50334-3, 17/50222-0, 19/25078-9, 20/06378-9, 19/08186-2)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

JESUS, Camila Chabi de. Identificação, caracterização e aspectos evolutivos dos vírus transmitidos por Brevipalpus que causam a leprose dos citros. 2020. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.