Busca avançada
Ano de início
Entree

Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica

Processo: 21/04368-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de junho de 2021
Vigência (Término): 28 de fevereiro de 2022
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Margaret de Castro
Beneficiário:Danillo Cunha de Almeida e Silva
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/03989-6 - Mecanismos fisiopatológicos e moleculares de tumorigênese: abordagem baseada em plataformas de sequenciamento em escala genômica (NGS - Next-Generation Sequencing), AP.TEM
Assunto(s):Transformação celular neoplásica   Biologia computacional

Resumo

Dados de RNA-seq e de exoma foram/estão sendo obtidos para diversos tumores (>180 amostras) e a complexidade bem como o volume dos dados pré-processados entregues pelas facilities /empresas que sequenciaram é enorme, exigindo conhecimento técnico específico para a manipulação e sumarização dos mesmos. O objetivo específico do bolsista é aplicar ferramentas já estabelecidas, mas de manuseio complexo que exige formação própria, de Aprendizado de Máquinas Supervisionado e Não-supervisionado para descoberta de transcritos marcadores e variantes gênicas para subtipos de tumores. Os subtipos podem ser definidos com base nas informações clínicas coletadas cuidadosamente pela equipe de biomédicos pós-doutores do Temático e que alimentam o aprendizado supervisionado (isto é, com classes conhecidas). Alternativamente os subtipos podem ser definidos com base na própria análise não-supervisionada onde algoritmos consagrados procuram por padrões e grupos naturais nos dados, estratificando-os se possível.

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias (0 total):
Mais itensMenos itens
VEICULO: TITULO (DATA)
VEICULO: TITULO (DATA)