Dinâmica molecular dos mecanismos de dissociação do hormônio estrógeno de seu receptor nuclear

• Processo: 05/53931-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2005
• Data de Término da vigência: 10 de abril de 2008
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Igor Polikarpov
• Beneficiário: Milton Taidi Sonoda
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 99/03387-4 - Estudos estruturais de proteínas usando luz síncrotron, AP.TEM
• Assunto(s): Estrógenos Receptores citoplasmáticos e nucleares Simulação de dinâmica molecular Isoformas de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Atividade Transcriptiva | Caminho De Dissociacao | Hormonio Estrogeno | Receptores Nucleares

Resumo

Receptores Nucleares (RN) são proteínas que complexam-se com regiões específicas do DNA, determinando quais genes serão expressos. A atividade dos RNs é regulada pela associação de hormônios. Pretendemos aplicar técnicas de simulação computacional por Dinâmica Molecular ao estudo dos RNs do hormônio estrógeno e suas interações com os respectivos ligantes naturais (hormônios) e análogos sintéticos, visando elucidar os mecanismos de ativação e inibição de receptores em escala atômica/molecular. Serão empregadas, de forma combinada, duas técnicas do estado da arte: a Dinâmica Molecular com Amostragem Ampliada (DMAA) e a Dinâmica Molecular com Caminho Induzido (DMCI). Com essas técnicas de simulação pretendemos encontrar os caminhos de dissociação dos ligantes da cavidade protéica e as razões da seletividade de alguns ligantes por uma das isoformas dos receptores. Inicialmente estudaremos o hormônio endógeno Estradiol, mas pretendemos extender este estudo a outros ligantes de interesse farmacológico, médico e biológico, conforme a disponibilidade de estruturas resolvidas por técnicas cristalográficas. (AU)