Simulações de dinâmica molecular dos receptores do hormônio tireoideano

• Processo: 06/06831-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2007
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2010
• Área de conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Química
• Pesquisador responsável: Munir Salomao Skaf
• Beneficiário: Leandro Martinez
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Assunto(s): Simulação de dinâmica molecular Química teórica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Dinamica Molecular | Hormonio Tireoidano | Química Teórica

Resumo

Os receptores nucleares são uma importante família de proteínas responsável pelo controle da transcrição de vários genes. São proteínas que se ligam ao DNA, e a associação de hormônios (Estrógeno, Hormônio Tireoideano, Vitamina A, entre outros) define se um determinado gene deve ser transcrito. Em 1995 as primeiras estruturas dos domínios destas proteínas responsáveis pela ligação dos hormônios foram obtidas. Isto permitiu um grande salto na compreensão da biologia molecular do reconhecimento hormonal. No entanto, apesar de que novas estruturas foram obtidas para diferentes receptores, o papel da dinâmica dos receptores em sua atividade permaneceu fundamentalmente desconhecido. Durante minha pós-graduação, estudei várias aspectos relacionados à dinâmica dos receptores nucleares e seu papel na função biológica destas proteínas. Obtivemos resultados que associam a dinâmica dos receptores à sua função para vários problemas diferentes, como a associação e a dissociação dos ligantes, as razões da seletividade destes ligantes e os mecanismos de desnaturação dos receptores, por exemplo. A complementação de alguns destes trabalhos usando novas técnicas que desenvolvemos deve complementar os estudos realizados durante minha tese de doutorado. A realização destes trabalhos nestas novas frentes deve levar à consolidação do conjunto de estudos realizados durante meu doutorado como um estudo bastante abrangente sobre a dinâmica de receptores nucleares. As três principais propostas de pesquisa que pretendemos realizar são:1. Estudar o mecanismo de entrada dos ligantes nos receptores. 2. Identificar os estados de transição do processo de desenovelamento dos receptores. 3. Obter caminhos ótimos de dissociação.

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

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LIBERATO, MARCELO VIZONA; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; AYERS, STEVEN D.; LIN, JEAN Z.; CVORO, ALEKSANDRA; SILVEIRA, RODRIGO L.; MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; SAIDEMBERG, DANIEL; DENG, TUO; et al. Medium Chain Fatty Acids Are Selective Peroxisome Proliferator Activated Receptor (PPAR) gamma Activators and Pan-PPAR Partial Agonists. PLoS One, v. 7, n. 5, MAY 23 2012. (04/08070-9, 06/06831-8, 06/00182-8)

MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; GARCIA, WANIUS; BATISTA, FERNANDA A. H.; PORTUGAL, RODRIGO V.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; NAKAHIRA, MARCEL; LIMA, LUIS M. T. R.; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. On the Denaturation Mechanisms of the Ligand Binding Domain of Thyroid Hormone Receptors. Journal of Physical Chemistry B, v. 114, n. 3, p. 1529-1540, JAN 28 2010. (06/06831-8, 06/00182-8)

DE ARAUJO, ALEXANDRE SUMAN; MARTINEZ, LEANDRO; NICOLUCI, RICARDO DE PAULA; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Structural modeling of high-affinity thyroid receptor-ligand complexes. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 39, n. 11, p. 1523-1536, OCT 2010. (06/06831-8, 06/01977-4, 06/00182-8)