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Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático

Texto completo
Autor(es):
Omar Julio Sosa
Número total de Autores: 1
Tipo de documento: Tese de Doutorado
Imprenta: São Paulo.
Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI)
Data de defesa:
Membros da banca:
Eduardo Moraes Rego Reis; Helena Paula Brentani; Edna Teruko Kimura; Ana Cristina Victorino Krepischi; Israel Tojal da Silva
Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis; João Carlos Setubal
Resumo

Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína. (AU)

Processo FAPESP: 13/13350-0 - Implementação de análises computacionais para identificação de novos biomarcadores para diagnóstico molecular de tumores pancreáticos a partir de dados de sequenciamento de nova geração
Beneficiário:Omar Julio Sosa
Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto