Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático

Autor(es)

Omar Julio Sosa

• Tipo de documento: Tese de Doutorado
• Imprenta: São Paulo.
• Instituição: Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Matemática e Estatística (IME/SBI)
• Data de defesa: 2019-02-27

Membros da banca

Eduardo Moraes Rego Reis; Helena Paula Brentani; Edna Teruko Kimura; Ana Cristina Victorino Krepischi; Israel Tojal da Silva

• Orientador: Eduardo Moraes Rego Reis; João Carlos Setubal

Resumo

Neste estudo foi implementado um pipeline bioinformático para processar e analisar dados de RNA-Seq total e fita-específico gerados em nosso laboratório a partir de amostras pareadas de tumor e tecido adjacente não tumoral de 14 pacientes com o objetivo de catalogar com alta-resolução a composição e alterações no transcritoma no PDAC incluindo genes codificadores e não codificadores de proteína. (AU)

• Processo FAPESP: 13/13350-0 - Implementação de análises computacionais para identificação de novos biomarcadores para diagnóstico molecular de tumores pancreáticos a partir de dados de sequenciamento de nova geração
• Beneficiário: Omar Julio Sosa
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto