Identificacao de locos de suscetibilidade a fissuras de labio e palato nao-sindromicas pela analise e eqtl (expression quantitative trait loci) em culturas de celulas-tronco mesenquimais.

Resumo

As fissuras orofaciais são os defeitos congênitos da face mais comumente observados em humanos. Apesar de mais de 400 síndromes genéticas apresentarem fissuras de lábio com ou sem fissura de palato (FL/P) como parte do fenótipo, 70% dos casos ocorre isoladamente (não-sindrômicas; FL/P NS). O modelo de herança das FL/P NS é multifatorial, e diversos genes/alelos candidatos para doença já foram identificados; entretanto, a maioria parece ter apenas um efeito modesto ou inconsistente sobre o fenótipo. Muitas variantes identificadas em estudos de associação recentes estão em regiões não-codificantes, possivelmente regulatórias, sugerindo que variações nos níveis de expressão de genes importantes para o desenvolvimento craniofacial podem estar associadas à doença. Considerando que os níveis de transcritos são caracteres quantitativos e altamente herdáveis, novos locos associados à regulação da transcrição têm sido identificados com estratégias de mapeamento de QTLs (quantitative trait loci), sendo esses locos cunhados como eQTLs (expression QTL). Utilizando o perfil global de expressão e genotipagem em larga escala com microarrays, é possível combinar o mapeamento de eQTLs com os resultados de estudos de associação, o que permite atribuir funções regulatórias aos sítios polimórficos das regiões genômicas com forte associação. Neste projeto propomos a identificação de novos genes de suscetibilidade para FL/P NS por meio da caracterização de eQTLs em linhagens de células-tronco mesenquimais adultas de controles e de pacientes com FL/P NS. Parte da análise do perfil de expressão dessas células já foi iniciada em nosso laboratório, tendo sido identificados genes diferencialmente expressos no grupo de pacientes. Identificando os eQTLs específicos dos genes diferencialmente expressos entre os grupos, testaremos a freqüência dessas variantes numa amostra maior de pacientes, de modo a confirmar associação com a doença. Para tanto, utilizaremos a estratégia de mapeamento por miscigenação. (AU)