Aprimorando a bioatividade de bacteriocinas de tipo pediocina por meio de abordagens in silico moleculares e estruturais.

Resumo

Bacteriocinas são peptídeos antimicrobianos naturalmente produzidos por algumas bactérias ácido lácticas, destacados por suas atividades inibitórias, especialmente contra alguns patógenos transmitidos por alimentos, como a Listeria, para a qual as bacteriocinas de tipo pediocina se destacam como agentes antimicrobianos. No entanto, ainda há muito a ser aprimorado para otimizar essa estratégia como substituta de antibióticos. A análise da sequência e estrutura das bacteriocinas por meio de métodos in silico permite a identificação de peptídeos e seus alvos moleculares para simulação de interações, com o objetivo de melhorar suas bioatividades. O presente estudo inclui a análise comparativa de múltiplas sequências de bacteriocinas do tipo pediocina, seu modelamento molecular, mecânica e dinâmica, identificação de alvos moleculares e propostas de modificações estruturais. Para isso, modelos tridimensionais serão construídos, energias de ligação calculadas e dinâmicas moleculares simuladas. Pretendemos obter informações sobre a diversidade de sequências, motivos funcionais, identificação de alvos, estados conformacionais e filogenia de bacteriocinas e bactérias produtoras, a fim de propor modificações estruturais para o aprimoramento da atividade antimicrobiana. Assim, esses peptídeos estudados podem ajudar a economizar recursos e proporcionar maior eficiência no combate a patógenos relevantes para a indústria de alimentos e saúde pública. Isso representa um passo notável na busca por aplicações probióticas, visando melhorar a qualidade dos alimentos e a saúde global