Characterization of gene expression profile of sugarcane-contrasting cultivars for drought stress

• Grant number: 08/06446-2
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Doctorate (Direct)
• Start date: March 01, 2009
• End date: August 31, 2012
• Field of knowledge: Biological Sciences - Botany - Pant Physiology
• Principal Investigator: Antonio Vargas de Oliveira Figueira
• Grantee: João Felipe Nebó Carlos de Oliveira
• Host Institution: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brazil

Abstract

A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) é uma das culturas mais importantes para a economia brasileira, fonte de matéria-prima para produção de açúcar e álcool. Para atender a crescente demanda do mercado interno e externo, o setor sucroalcooleiro deverá expandir a área cultivada com cana-de-açúcar, utilizando-se para isto áreas de cerrado e pastagens degradadas nas regiões Sudeste e Centro-Oeste, caracterizadas por um inverno seco com períodos de deficiência hídrica acentuada. Nos últimos 10 anos, cerca de 80 cultivares de cana-de-açúcar foram desenvolvidas no Brasil, porém poucas com potencial produtivo para o cultivo nas condições de cerrado. Mecanismos de resposta e tolerância ao déficit hídrico têm sido investigados em espécies como arroz e arabidopsis, cujos genes responsivos ao estresse hídrico foram classificados em dois grupos: o primeiro incluindo proteínas que agem diretamente no combate ao estresse, e o segundo incluindo genes regulatórios. Estudos prévios de resposta à seca em cana-de-açúcar sugeriram similaridades na atuação dos genes ortólogos aos do segundo grupo de arroz e arabidopsis, porém os genes atuantes diretamente na proteção e combate ao estresse ainda permanecem desconhecidos. A elucidação dos mecanismos adotados pela cana-de-açúcar na tolerância ao déficit hídrico seria de grande valor para o desenvolvimento de genótipos tolerantes, estando estritamente relacionado à sustentabilidade e viabilidade econômica dessa cultura em áreas sujeitas ao déficit hídrico, contribuindo também para a redução do uso da irrigação. Este trabalho pretende analisar o perfil da expressão gênica de genótipos de cana-de-açúcar contrastantes à seca, utilizando-se para isso análises comparativas de microarranjos de cDNA, seguidas de validação da expressão gênica via RT-qPCR para caracterizar genes diferencialmente expressos em genótipos de cana-de-açúcar contrastantes para a tolerância ao déficit hídrico. (AU)

Scientific publications

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

CONTILIANI, DANYEL FERNANDES; DE OLIVEIRA NEBO, JOAO FELIPE CARLOS; RIBEIRO, RAFAEL VASCONCELOS; ANDRADE, LARISSA MARA; PEIXOTO JUNIOR, RAFAEL FAVERO; LEMBKE, CAROLINA GIMILIANI; MACHADO, RICARDO SILVERIO; SILVA, DANIEL NUNES; BELLOTI, MARIANA; DE SOUZA, GLAUCIA MENDES; et al. Leaf transcriptome profiling of contrasting sugarcane genotypes for drought tolerance under field conditions. SCIENTIFIC REPORTS, v. 12, n. 1, p. 12-pg., 2022-06-01. (08/06446-2, 21/13478-2, 08/57923-5, 08/52146-0, 11/50661-8)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

OLIVEIRA, João Felipe Nebó Carlos de. Physiological characterization and gene expression profiling of sugarcane (Saccharum spp) genotypes contrasting for drought tolerance. 2013. Doctoral Thesis - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.