Cyanobacterial diversity in the phyllosphere plants from the São Paulo State Atlantic Forest

• Grant number: 09/12192-6
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Master
• Start date: March 01, 2010
• End date: July 31, 2011
• Field of knowledge: Agronomical Sciences - Agronomy - Soil Science
• Principal Investigator: Marli de Fátima Fiore
• Grantee: Natalia Juliana Nardelli Gonçalves
• Host Institution: Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brazil
• Associated research grant: 08/50824-1 - Microbial diversity in the phyllosfhere and soil of the Atlantic Forest, AP.BTA.TEM

Abstract

Em estudos de ecologia microbiana a aplicação de técnicas baseadas na amplificação por PCR e/ou seqüenciamento de ácidos nucléicos (DNA ou RNA) de amostras ambientais permite a análise de maneira independente de cultivo dos microrganismos presentes nessas amostras, o que exclui todos os problemas e limitações inerentes da culturabilidade das comunidades bacterianas. A filosfera é um nicho bastante rico em espécies bacterianas que tem sido pouco explorado em estudos de ecologia microbiana. Pesquisa em andamento no Laboratório de Ecologia Molecular de Cianobactérias (CENA-USP), financiada pelo programa Biota (FAPESP), têm gerado informações sobre cianobactérias colonizadoras da filosfera de espécies arbóreas de manguezais. O presente trabalho tem como objetivo gerar informações sobre a diversidade de cianobactérias presentes na filosfera de plantas da Mata Atlântica. A estrutura da diversidade cianobacteriana será avaliada por meio da técnica de PCR-DGGE, após a extração de DNA genômico de amostras da superfície foliares e amplificação por PCR de fragmentos do gene DNAr 16S. As identidades das cianobactérias colonizadoras, inclusive as não cultiváveis serão acessadas por meio da construção de bibliotecas do gene de DNAr 16S. Desta forma, este estudo sobre cianobactérias da filosfera da Mata Atlântica tem relevância taxonômica para o filo Cyanobacteria e também para o ambiente a ser explorado, cuja diversidade microbiana ainda é pouco conhecida. Considerando-se a importância da cianobactérias na ciclagem de nutrientes e as características fisiológicas únicas de fixação de CO2 e N2 que são essenciais para a sustentabilidade dos ecossistemas, conhecer sua diversidade e suas funções é de real importância para futuros benefícios nos biomas onde se encontram.

Academic Publications

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GONÇALVES, Natalia Juliana Nardelli. Cyanobacterial diversity in the phyllosphere of the Atlantic Forest of São Paulo state. 2011. Master's Dissertation - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.