Metagenomics approach and association with surface and subsurface carbon biogeochemical processes using qPCR

• Grant number: 24/04172-5
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: April 01, 2024
• End date: July 31, 2025
• Field of knowledge: Physical Sciences and Mathematics - Geosciences - Geology
• Principal Investigator: André Oliveira Sawakuchi
• Grantee: Alessandro Oliveira de Moraes Nogueira
• Host Institution: Instituto de Geociências (IGC). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brazil
• Associated research grant: 18/23899-2 - Trans-Amazon Drilling Project: origin and evolution of the forests, climate, and hydrology of the South American tropics, AP.PFPMCG.TEM

Abstract

O treinamento técnico delineado neste projeto auxiliará o desenvolvimento de trabalhos que buscam informações sobre o funcionamento das comunidades microbianas de superfície e subsuperfície em áreas de interesse na Bacia do Rio Amazonas. Mais especificamente, o projeto foca na organização de amostras e metadados para análises químicas e moleculares, na implementação de protocolos, e na preparação de amostras para análises de DNA, RNA e cromatografia. Entre as atividades desenvolvidas, estão inclusas: (a) Organização e destinação das amostras para análises de DNA e RNA; (b) Preparação das amostras de solo, sedimento e rocha para análises de DNA e RNA; (c) Organização dos metadados para análises químicas e moleculares; (d) Extração e purificação de DNA de amostras de solo, sedimento e rocha; (e) Preparação e análise por cromatografia gasosa de amostras de gás, solo, sedimento e rocha. Ao término do projeto, espera-se que o bolsista tenha contribuído efetivamente com o bom desenvolvimento das atividades associadas ao Projeto Temático FAPESP "Projeto de Perfuração Transamazônica: origem e evolução das florestas, clima e hidrologia dos trópicos da América do Sul", enriquecendo seus conhecimentos técnicos e favorecendo sua integração em uma rede de pesquisadores de excelência.