Experimental Practices for the Study of Lipid Domain Formation Induced by Intrinsically Disordered Peptides.

• Grant number: 25/16298-6
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: September 01, 2025
• End date: August 31, 2027
• Field of knowledge: Physical Sciences and Mathematics - Physics - Condensed Matter Physics
• Principal Investigator: Vitor Barbanti Pereira Leite
• Grantee: Marcia Perez dos Santos Cabrera
• Host Institution: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Araraquara. Araraquara , SP, Brazil
• Associated research grant: 22/07231-7 - Plasticity and functional modulation of intrinsically disordered proteins, AP.TEM

Abstract

Nossa hipótese é que mudanças ocorrendo na superfície de células apoptóticas ou bacterianas - tais como variações na compressibilidade, elasticidade e fluidez moduladas por diferenças na composição lipídica - sejam fatores-chave para a seletividade de peptídeos intrinsicamente desordenados (IDPs) em relação a essas células. A associação desses peptídeos com membranas afeta fortemente as propriedades estruturais e dinâmicas de lipídeos, rompendo ou perturbando o empacotamento lipídico. Consequentemente, significativa atenção vem sendo dirigida em direção aos efeitos em propriedades mecanicas de membranas induzidas pelas interações peptidicas, correlacionadas tanto a forças eletrostáticas como não-eletrostáticas a sua ação lítica. Neste projeto, o técnico será responsável pela preparação das amostras lipídics (monocamadas, vesículas multilamelares (MLVs), vesículas grandes unilamelares (LUVs), e vesículas gigantes (GUVs) e pela aquisição de dados da formação de domínios usando microscopia ótica e de fluorescência. O técnico também contribuirá na implementação de análise numérica de domínios lipídicos afetados pelos peptideos antimicrobianos (IDPs). Adicionalmente, o técnico auxiliará no estabelecimento da análise de single-particle tracking (SPT) para observar o comportamento dinamico de nanopartículas dentro de filmes lipídicos. O coeficiente de difusão (D) de nanobeads flutuando na monocamada será determinado através da analise do seu deslocamento relativo decorrente do movimento Browniano. Monocamadas lipídicas oferecem uma vantagem especial sobre outros sistemas modelo, pois sua densidade de empacotamento pode ser modulada a temperatura constante. Para esses experimentos uma balança de filme de Langmuir (Trough, kibron, Helsinki, Finland) será posicionada na plataforma de um microscópio de fluorescencia invertido. Todos os experimentos serão conduzidos no laboratório de Alvares & Ruggiero, IBILCE - UNESP, onde o equipamento necessário já está instalado.