Development of Scripts for Analysis and Manipulation of Data Generated from Cryo-EM Maps

• Grant number: 26/04519-0
• Support Opportunities: Scholarships in Brazil - Technical Training Program - Technical Training
• Start date: April 01, 2026
• End date: September 30, 2026
• Field of knowledge: Biological Sciences - Biophysics - Molecular Biophysics
• Principal Investigator: Ana Lígia Barbour Scott
• Grantee: Isabelle Alves Pereira
• Host Institution: Centro de Matemática, Computação e Cognição (CMCC). Universidade Federal do ABC (UFABC). Santo André , SP, Brazil
• Associated research grant: 24/18588-9 - Conformational Heterogeneity and transition states based on Cryo-EM maps and hybrid methods, AP.R

Abstract

O objetivo do bolsista no projeto será auxiliar no desenvolvimento de pipelines utilizandoPython para analisar os resultados gerados pela nova versão do MDFF_NM que o auxílio regular, ao qual está vinculado, irá gerar. Além disso, o bolsista implementará um banco de dados para organizar os inúmeros scripts desenvolvidos pelogrupo com intuito de intensificar o resreuso de códigoO bolsista também auxiliará em scripts para manipulação de mapas de Cryo-EM e naIntegração, como plugin, do MDFF_NM nos softwares Chimera-X e VMD. (AU)