Epigenetic and genome sequencing studies of cultured cyanobacteria Phormidium sp. submitted to putative elicitors

• Grant number: 09/07429-7
• Support Opportunities: Scholarships abroad - New Frontiers
• Start date: March 01, 2010
• End date: February 28, 2011
• Field of knowledge: Physical Sciences and Mathematics - Chemistry - Organic Chemistry
• Principal Investigator: Hosana Maria Debonsi
• Grantee: Hosana Maria Debonsi
• Host Investigator: William H. Gerwick
• Host Institution: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brazil
• Institution abroad: University of California, San Diego (UC San Diego), United States

Abstract

A importância dos produtos naturais marinhos nos processos de descoberta e desenvolvimento de fármacos, devido às suas estruturas únicas associadas aos efeitos biológicos que exercem, é fundamentada pela literatura científica. Porém, nos últimos anos, pesquisadores têm se deparado com um grande problema: a escassa quantidade de massa obtida. Sendo assim, novas metodologias têm sido empregadas na busca por compostos com a quantidade de massa suficiente para a realização de experimentos in vitro e in vivo. Dentre estas técnicas podemos destacar o uso de elicitores em culturas da cianobactéria Phormidium sp., os quais levaram ao aumento da produção de um metabólito de interesse em 1000 vezes. Neste contexto, estudos epigenéticos utilizando elicitores específicos (como inibidores de histona) poderão ser empregados em culturas de Phormidium. Ainda, os estudos de clusters de genes biossintéticos vem como ferramenta fundamental para o sequenciamento genômico da linhagem desejada. Desta forma, estarei participando dos experimentos para sequenciamento do genoma da linhagem selecionada e utilizarei bioinformática para elucidar a estrutura dos genes responsáveis pela indução da formação da substância de interesse. A última etapa do estágio de pós-doutorado consistirá na produção de uma coleção de fosmídios a partir da linhagem promissora, utilizando para isso primers específicos. Portanto, por meio do estágio supervisionado pelo Prof. Dr. William H. Gerwick (Professor do Scripps Institution of Oceanography and Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, University of California San Diego, USA) obterei os conhecimentos necessários para aplicar estas novas abordagens na Química de Produtos Naturais Marinhos do Brasil. (AU)