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João Meidanis

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Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Instituto de Computação (IC)  (Institutional affiliation for the last research proposal)
Birthplace: Brazil

Joao Meidanis holds a bachelor's degree in Mathematics from the University of São Paulo (1980), a master's degree in Mathematics from the same school (1985), a master's degree in Computer Sciences from the University of Wisconsin-Madison (1989) and a PhD degree in Computer Sciences from the University of Wisconsin-Madison (1992). His research focuses on analysis of algorithms, graph theory, computational biology, bioinformatics, and optimization. (Source: Lattes Curriculum)

Articles published in Pesquisa FAPESP Magazine about the researcher:
Mapping sugarcanes 
El mapa de la caña de azúcar 
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Keywords used by the researcher
Scientific publications resulting from Research Grants and Scholarships under the grantee's responsibility (9)

(References retrieved automatically from Web of Science and SciELO through information on FAPESP grants and their corresponding numbers as mentioned in the publications by the authors)

Publications9
Citations61
Cit./Article6.8
Data from Web of Science

PEREIRA ZANETTI, JOAO PAULO; BILLER, PRISCILA; MEIDANIS, JOAO. Median Approximations for Genomes Modeled as Matrices. Bulletin of Mathematical Biology, v. 78, n. 4, p. 786-814, . Web of Science Citations: 3. (12/13865-7, 12/14104-0)

SANKOFF, DAVID; ZHENG, CHUNFANG; ZHANG, YUE; MEIDANIS, JOAO; LYONS, ERIC; TANG, HAIBAO. Models for Similarity Distributions of Syntenic Homologs and Applications to Phylogenomics. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 16, n. 3, p. 727-737, . Web of Science Citations: 4. (16/01511-7)

CHINDELEVITCH, LEONID; LA, SEAN; MEIDANIS, JOAO. A cubic algorithm for the generalized rank median of three genomes. Algorithms for Molecular Biology, v. 14, . Web of Science Citations: 0. (16/01511-7)

RAJARAMAN, ASHOK; PEREIRA ZANETTI, JOAO PAULO; MANUCH, JAN; CHAUVE, CEDRIC. Algorithms and Complexity Results for Genome Mapping Problems. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 14, n. 2, p. 418-430, . Web of Science Citations: 2. (13/07868-6)

BILLER, PRISCILA; GUEGUEN, LAURENT; KNIBBE, CAROLE; TANNIER, ERIC. Breaking Good: Accounting for Fragility of Genomic Regions in Rearrangement Distance Estimation. GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, v. 8, n. 5, p. 1427-1439, . Web of Science Citations: 9. (13/25084-2)

BILLER, PRISCILA; GUEGUEN, LAURENT; TANNIER, ERIC. Moments of genome evolution by Double Cut-and-Join. BMC Bioinformatics, v. 16, n. 14, . Web of Science Citations: 8. (13/25084-2)

FEIJAO, PEDRO; MEIDANIS, JOAO. SCJ: A Breakpoint-Like Distance that Simplifies Several Rearrangement Problems. IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, v. 8, n. 5, p. 1318-1329, . Web of Science Citations: 35. (09/09307-6)

GIUSTI, GUILHERME NAVARRO NILO; JOTTA, PATRICIA YOSHIOKA; LOPES, CAROLINE DE OLIVEIRA; GANAZZA, MONICA APARECIDA; AZEVEDO, AMILCAR CARDOSO; BRANDALISE, SILVIA REGINA; MEIDANIS, JOAO; YUNES, JOSE ANDRES. Test trial of spike-in immunoglobulin heavy-chain (IGH) controls for next generation sequencing quantification of minimal residual disease in acute lymphoblastic leukaemia. British Journal of Haematology, v. 189, n. 4, . Web of Science Citations: 0. (18/00031-7, 17/03942-8)

Academic Publications

(References retrieved automatically from State of São Paulo Research Institutions)

TELLES, Guilherme Pimentel. Propriedade dos uns consecutivos e arvores PQR. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (96/08571-0

BRAGA, Marilia Dias Vieira. Grafos de sequencias de DNA. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (97/11629-2

FORTUNA, Vinicius Jose. Distancias de transposição entre genomas. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (03/04578-5

TELLES, Guilherme Pimentel. Um algoritmo quase-linear para arvores PQR e um esquema para clustering de sequencias expressas de cana-de-açucar. Tese (Doutorado) -  Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (97/12126-4

COGO, Patricia Pilisson. Comparação de genomas completos de especies da familia Vibrionacea empregando rearranjo de genomas. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (05/53279-6

BILLER, Priscila Do Nascimento. Statistical analysis of evolution by genome rearrangements = Análise estatística da evolução por rearranjo de genomas. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.  (12/14104-0

ZANETTI, João Paulo Pereira. Methods for phylogenetic reconstruction = Métodos de reconstrução filogenética. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.  (12/13865-7

DIAS, Zanoni. Rearranjo de genomas : uma coletanea de artigos. Tese (Doutorado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (98/04432-0

PINTO, Marcelo Cezar. Um algoritmo para comparação sintatica de genomas baseado na complexidade condicional de Kolmogorov. Dissertação (Mestrado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (00/04776-3

MIRA, Cleber Valgas Gomes. Analise algebrica de problemas de rearranjo em genomas : algoritmos e complexidade. Tese (Doutorado) -  Instituto de Computação.  Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP).  (03/00731-3

BILLER, Priscila Do Nascimento. Statistical analysis of evolution by genome rearrangements = Análise estatística da evolução por rearranjo de genomas. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.  (12/14104-0

ZANETTI, João Paulo Pereira. Methods for phylogenetic reconstruction = Métodos de reconstrução filogenética. Tese (Doutorado) -  Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação.  (12/13865-7

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